A história genética de África é composta pela história genética das populações da África, de todas as regiões do continente, bem como a origem recente dos humanos modernos na África. O Saara serviu como passagem transregional e local de residência para as pessoas na África durante várias fases úmidas e períodos ao longo da história da África.
Visão geral Os povos da África são caracterizados por uma subestrutura genética regional e heterogeneidade, dependendo da respectiva identidade etnolinguística, e, em parte, explicável pela "evolução multirregional" das linhagens humanas modernas em várias regiões do continente africano, bem como eventos de mistura posteriores, incluindo migrações de retorno da Eurásia, de componentes altamente diferenciados.
A ancestralidade genética dos africanos é, em grande parte, dividida pela geografia e família linguística, com populações pertencentes aos mesmos grupos etnolinguísticos apresentando elevada homogeneidade e coerência genética. O fluxo genético, consistente com eventos de migração de curto e longo alcance seguidos de extensa mistura e efeitos de gargalo, influenciou a composição genética regional e a estrutura demográfica dos africanos. A expansão banta teve impactos duradouros na composição demográfica moderna da África, resultando em uma maior homogeneização genética e linguística. Estudos genéticos, arqueológicos e linguísticos acrescentaram informações adicionais sobre este movimento: "Nossos resultados revelam uma continuidade genética entre populações falantes de línguas nigero-congolesas em todo o continente e ampliam nossa compreensão atual [...] da migração dos bantos."
De um modo geral, diferentes populações africanas apresentam diversidade genética e subestrutura, mas podem ser agrupadas em agrupamentos distintos, mas parcialmente sobrepostos:
As linhagens de caçadores-coletores coissãs da África Austral são as mais profundas, formando um aglomerado divergente e distinto afastado do restante dos africanos subsaarianos e divergem ainda mais deles do que as várias linhagens eurasianas. A data de divergência desses caçadores-coletores do Sul da África das demais populações humanas é estimada em mais de 100 mil anos atrás e essa linhagem se dividiu em dois subgrupos, um do norte e outro do sul, há cerca de 30 mil anos. Povos de florestas tropicais africanas como os bacas e os mbutis divergiram de outros grupos da África Subsaariana há mais de 60 mil anos. Grupos orientais como os mbutis se separaram de grupos ocidentais como os bacas há cerca de 20 mil anos. É sugerido que os vários povos falantes de línguas afro-asiáticas tenham divergido de outros grupos africanos há cerca de 50 mil anos. Os falantes de línguas nigero-congolesas e nilo-saarianas se separaram há cerca de 28 mil anos. Os malgaxes possuem uma porcentagem significativa de sua ancestralidade oriunda do Leste e Sudeste Asiático.
Povos autóctones africanos As populações autóctones da África consistem em falantes de línguas nigero-congolesas, nilo-saarianas e do divergente e diversificado agrupamento coissã, bem como de vários agrupamentos etnolinguísticos não classificados ou isolados. A origem das línguas afro-asiáticas permanece controversa, com alguns propondo uma origem no Oriente Médio, enquanto outros apoiam uma origem africana com vários graus de componentes eurasianos e africanos. As línguas austronésias originaram-se no sul da China e posteriormente se expandiram a partir de Taiwan e Filipinas.
As línguas nigero-congolesas provavelmente se originaram na região onde essas línguas eram faladas antes da expansão banta, ou seja, a África Ocidental ou Central. A sua expansão pode ser associada à expansão da agricultura, no período Neolítico africano, na sequência da desertificação do Saara por volta de 3.500 a.C. A língua proto-nigero-congolesa pode ter se originado há cerca de 10 mil anos onde aproximadamente é hoje o Sahel e o sul do Saara e sua dispersão pode estar correlacionada com a disseminação do arco e flecha pela migração de caçadores-coletores, que mais tarde desenvolveram a agricultura.
Embora a validade da família nilo-Saariana permaneça controversa, é provável que tenha surgido na região entre os atuais Chade, Sudão e República Centro-Africana antes da sua dispersão por volta de 10.000–8.000 a.C.miniaturadaimagem|347x347px| Rotas de migração humana para fora da África. Evento fora da África
O modelo da “origem africana recente dos humanos modernos” propõe uma origem única do Homo sapiens na África no sentido taxonômico. Dados genéticos e arqueológicos recentes sugerem que os subgrupos do Homo sapiens se originaram em múltiplas regiões da África. O grupo ancestral dos eurasiáticos provavelmente deixou o Chifre da África entre 70 e 100 mil anos atrás. O modelo de “origem africana recente” propõe que todas as populações modernas não-africanas descendem de uma ou várias ondas de humanos que deixaram a África entre 70 e 60 mil anos. miniaturadaimagem|214x214px|Migrações humanas e haplogrupos de DNA mitocondrial. De acordo com Durvasula et al. (2020), há indicações de que 2% a 19% do DNA das populações da África Ocidental pode ter vindo de um hominídeo arcaico desconhecido que se separou do ancestral dos humanos e dos neandertais entre 360 mil e 1,02 milhão de anos atrás. No entanto, eles também sugerem que pelo menos parte desta mistura arcaica também está presente em não-africanos e que o evento ou eventos de mistura variam de 0 a 124 mil anos atrás, que inclui o período anterior à migração para fora de África, afetando, assim, em parte, os antepassados comuns tanto dos africanos como dos não-africanos. Chen et al. (2020) descobriram que os africanos têm ancestralidade neandertal mais elevada do que se pensava anteriormente. 2.504 amostras africanas de todo o continente foram analisadas e testadas em ancestralidade neandertais e todas elas mostraram evidências de ascendência neandertal menor.
A ancestralidade neandertal na África, em média, é de 0,3%, comparada aos 2% dos europeus e asiáticos orientais. miniaturadaimagem|212x212px|Migrações humanas e haplogrupos do cromossomo Y.
Fluxo genético entre populações da Eurásia e África miniaturadaimagem| "História da população africana antes e depois da agricultura. (a) Mapa da principal estratificação da população pré-agrícola em todo o continente africano, mostrando não-africanos e norte-africanos (azul), africanos orientais (amarelo), africanos ocidentais (cinza), caçadores-coletores da floresta tropical da África Central (verde), e caçadores-coletores coissãs da África Austral (vermelho). (b) Rotas de migração relacionadas com a expansão de pastores e agricultores durante o Holoceno. As setas cinzentas representam a expansão banta, as setas azuis representam as retromigrações da Eurásia, a seta castanha/azul representa a migração para o sul de pastores misturados da África Oriental e da Eurásia, e a seta cinzenta/castanha representa a migração bidirecional ao longo do cinturão do Sahel. Abreviatura: kya – mil anos atrás."|271x271px Uma mistura eurasiática significativa é encontrada no Norte da África e entre grupos étnicos específicos do Chifre da África, bem como entre os malgaxes. Vários estudos genômicos encontraram evidências de múltiplas migrações pré-históricas de várias populações da Eurásia e subsequente mistura com grupos nativos. O fluxo genético da Eurásia Ocidental (Europa e Oriente Médio) chegou ao Norte de África entre 30 e 15 mil anos atrás, seguido por outros eventos de migração. Os dados genéticos nas amostras da Gruta de Taforalt, no Marrocos, "demonstraram que o Norte da África recebeu quantidades significativas de fluxo genético da Eurásia antes do Holoceno e do desenvolvimento de práticas agrícolas". Eventos medievais de fluxo genético, como a expansão árabe, também deixaram vestígios em várias populações africanas. Pickrel et al. (2014) indicaram que a ascendência da Eurásia Ocidental acabou por chegar, através do Chifre da África, à África Austral.
Ramsay et al. (2018) também encontraram evidências de uma mistura significativa da Eurásia Ocidental em várias partes da África, tanto de migrações antigas quanto mais recentes, sendo mais alta entre populações do Norte da África e alguns grupos do Chifre da África:Além da diversidade intrínseca no continente devido à estrutura populacional e isolamento, a migração das populações eurasiáticas para a África emergiu como um contribuinte crítico para a diversidade genética. Estas migrações envolveram o influxo de diferentes populações eurasiáticas em diferentes épocas e para diferentes partes do continente africano. A caracterização abrangente dos detalhes destas migrações através de estudos genéticos em populações existentes poderia ajudar a explicar as fortes diferenças genéticas entre algumas populações geograficamente vizinhas.
Esta mistura distinta da Eurásia parece ter ocorrido durante pelo menos três períodos de tempo, com a mistura antiga no centro-oeste da África (por exemplo, iorubás da Nigéria) ocorrendo entre aproximadamente 7,5 e 10,5 mil anos atrás, a mistura mais antiga na África Oriental (por exemplo, Etiópia) ocorrendo entre aproximadamente 2,4 e 3,2 mil anos atrás e mistura mais recente entre cerca de 0,15 e 1,5 mil anos atrás em algumas populações da África Oriental (por exemplo, Quênia).
Estudos subsequentes baseados na decadência de LD e na partilha de haplótipos em um extenso conjunto de populações africanas e eurasiáticas confirmaram a presença de assinaturas eurasiáticas nos africanos ocidentais, orientais e meridionais. No oeste, além dos falantes de línguas nigero-congolesas da Gâmbia e Mali, os mossis de Burkina Faso apresentaram o mais antigo evento de mistura eurasiática, há aproximadamente 7 mil anos. No leste, estas análises inferiram a mistura eurasiática no Quênia nos últimos 4 mil anos. Chen et al. (2020) analisaram 2.504 amostras africanas de todo o continente e encontraram alguma pouca ancestralidade neandertal entre todas as amostras africanas testadas. Eles também identificaram um segmento de ancestralidade relacionado à Europa (Eurásia Ocidental), que parece corresponder em grande parte aos componentes de ancestralidade neandertal detectados. A mistura relacionada com a Europa entre os africanos foi estimada entre perto de 0% e até 30%, com um pico entre os norte-africanos. Eles afirmaram: "Estes dados são consistentes com a hipótese de que a retromigração contribuiu para o sinal da ascendência neandertal nos africanos. Além disso, os dados indicam que esta migração de retorno ocorreu após a divisão dos europeus e dos asiáticos orientais, de uma população relacionada com a linhagem europeia."
Hollfelder et al. (2021) concluíram que os iorubás, que anteriormente eram usados como "população de referência não misturada" para os africanos autóctones, abrigam níveis menores de ancestralidade neandertal, o que pode ser amplamente associado à retromigração de uma população de origem "semelhante à europeia ancestral".
Genética africana fora da África Os habitantes do Levante da Cultura natufiana e Neolítico Pré-Cerâmico possuíam 6,8% de ascendência relacionada aos omóticos, uma população do sudoeste da Etiópia. As populações autóctones modernas do Levante possuem entre 1 e 3% de sua genética oriunda de populações próximas aos omóticos. Os árabes nativos da Península Arábica possuem mais ancestralidade africana subsaariana do que os levantinos.
Um estudo de 2013, de Botigué et. al., afirma que, com exceção das Ilhas Canárias, a ascendência africana subsaariana na Europa é sempre menor que 1%.
Os habitantes do Sul da Itália e da Península Ibérica possuem uma pequena porcentagem do seu material genético oriundo do Norte da África.
Entre os séculos XVI e XIX, cerca de 11 milhões de africanos escravizados, a imensa maioria dos quais falantes de línguas nigero-congolesas, desembarcaram nas Américas, impactando na formação da população de diversas regiões desse continente.