miniatura|Schemă simplificată de secvențiere rapidă: mai întâi, fragmentul de ADN este secvențiat în bucăți mici, suprapuse. Apoi, fiecare fragment este secvențiat, iar secvența completă este asamblată pe baza similarității capetelor suprapuse. Această abordare poate fi aplicată doar genomurilor mici sau fragmentelor de genomuri mai mari, datorită prezenței mai multor secvențe repetitive.Secvențierea shotgun este o metodă de secvențiere ADN. Denumirea (în , shotgun = pușcă de vânătoare) este o analogie la modelul aleatoriu de tragere al unei puști automate. Secvențierea Sanger poate fi aplicată numai pentru șiruri relativ scurte de nucleotide (până la 1000 de baze). Secvențele mai lungi sunt fragmentate, iar asamblarea acestora se face computerizat.
Secvențierea shotgun presupune fragmentarea ADN-ului în numeroase segmente de mici dimensiuni, care sunt mai apoi secvențiate prin metoda Sanger și care produc citiri. Mai multe citiri suprapuse sunt obținute de-a lungul a mai multor ture de secvențiere. Programele bioinformatice asamblează citirile într-o secvență continuă.
Vezi si Secvențierea Sanger Secvențierea nanopore Secvențiere în timp real a unei singure molecule Secvențierea Ion Torrent
Note
Categorie:ADN