Subgenul Decacovirus este un subgen de coronavirusuri din genul Alphacoronavirus care include 2 specii de coronavirusuri: alfacoronavirusul HuB-2013 al liliacului Rhinolophus ferrumequinum (Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013) și coronavirusul HKU10 al liliecilor (Bat coronavirus HKU10).Decacovirus. NCBI taxonomy databaseDecaro, N., Lorusso, A. (2020). Novel human coronavirus (SARS-CoV-2): A lesson from animal coronaviruses. Veterinary Microbiology, Volume 244, May 2020, 108693 Ambele specii nu sunt zoonotice, adică nu se transmit la om.Helmy YA, Fawzy M, Elaswad A, Sobieh A, Kenney SP, Shehata AA. The COVID-19 pandemic: a comprehensive review of taxonomy, genetics, epidemiology, diagnosis, treatment, and control. J Clin Med 2020; 9(4):E1225-E1225.
Alfacoronavirusul HuB-2013 al liliacului Rhinolophus ferrumequinum include 2 tulpini virale: BtMs-AlphaCoV/GS2013 și BtRf-AlphaCoV/HuB2013. Tulpina BtMs-AlphaCoV/GS2013 (GenBank nr. KJ473810BtMs-AlphaCoV/GS2013, complete genome. GenBank.) a fost descoperită în 2013 în provincia Gansu, China, la liliecii cu urechi de șoarece (Myotis spp.). Tulpina BtRf-AlphaCoV/HuB2013 (GenBank nr. NC_028814 BtRf-AlphaCoV/HuB2013, complete genome. GenBank.) a fost descoperită tot în 2013 în provincia Hubei, China, la liliecii mari cu potcoavă (Rhinolophus ferrumequinum). Ambele tulpini au o identitate foarte mari a secvențelor genetice (peste 98%), dar mai mică a genelor care codifică proteina spiculară S (numai 85% de nucleotide sunt identice).Wu, Z., Yang, L., Ren, X., He, G., Zhang, J., Yang, J., Qian, Z., Dong, J., Sun, L., Zhu, Y., Du, J., Yang, F., Zhang, S., Jin, Q., 2016. Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases. ISME J. 10, 609-620.
A doua specie a subgenului, coronavirusul HKU10 al liliecilor, a fost descoperită în 2005 în China la liliecii ruzet, numiți și câini zburători (Rousettus spp. - GenBank nr. NC_018871Rousettus bat coronavirus HKU10, complete genome. GenBank.) și la liliecii filorini (Hipposideros spp.). Alte tulpini de la liliecii filorini (Hipposideros spp.) au fost apoi descoperite în 2006 și 2010.Lau, S.K., Li, K.S., Tsang, A.K., Shek, C.T., Wang, M., Choi, G.K., Guo, R., Wong, B.H., Poon, R.W., Lam, C.S., Wang, S.Y., Fan, R.Y., Chan, K.H., Zheng, B.J., Woo, P.C., Yuen, K.Y., 2012. Recent transmission of a novel alphacoronavirus, bat coronavirus HKU10, from Leschenault's rousettes to pomona leaf-nosed bats: first evidence of interspecies transmission of coronavirus between bats of different suborders. J. Virol. 86, 11906-11918. O tulpină virală asemănătoare cu HKU10 a fost identificată la liliacul filorin pomon (Hipposideros pomona) în 2018 în China (GenBank nr. MN611523Hipposideros pomona bat coronavirus HKU10-related isolate 160942, complete genome. GenBank.).
Referințe
Categorie:Alphacoronavirus