Протеоформы () — белковые группы или белковые виды, возникающие за счет модификаций белка: аминокислотных замен (полиморфизм единичных аминокислот) (SAP), альтернативного сплайсинга (AS) и посттрансляционных модификаций (PTM), например фосфорилирования. Термин “белковый вид” или “протеоформа” относится к самой малой единице протеома, то есть полипептиду, имеющему уникальную последовательность и несущему уникальный набор посттрансляционных модификацийНарыжный, С. Н., Згода, В. Г., Майнскова, М. А., Ронжина, Н. Л., Белякова, Н. В., Легина, О. К., & Арчаков, А. И. (2015). Экспериментальная оценка размера протеомов клеток и плазмы крови человека. Биомедицинская химия, 61(2), 279-285.. Данный термин не стоит путать с изоформой, более частным термином, характеризующим только аминокислотную последовательность.
Проект "Протеом человека" Целью основной фазы проекта «Протеом человека» являлось дополнение мастерного протеома сведениями о формах белков, возникающих в результате различных модификаций – наличия несинонимичных одно-нуклеотидных полиморфизмов в геноме, процессов альтернативного сплайсинга и пострансляционных модификаций. В результате вместо полученного на пилотной фазе мастерного протеома, когда одному гену соответствовал только один (мастерный) белок, в основной фазе проекта было проанализировано всё многообразие возможных протеоформ, кодируемых одним геном. Один ген может кодировать до 100 белков (то есть несколько миллионов протеоформ в масштабах организма) или несколько десятков тысяч для 18-й хромосомы человека. Основная фаза проекта “Протеом человека” позволит осуществить критическую оценку существующих биоинформатических предсказательных алгоритмов и, возможно, разработать новые алгоритмы, опирающиеся на экспериментальные данные по детектированию неканонических протеоформПономаренко, Е. А., Згода, В. Г., Копылов, А. Т., Поверенная, Е. В., Ильгисонис, Е. В., Лисица, А. В., & Арчаков, А. И. (2015). Россия в международном проекте “протеом человека”: первые итоги и перспективы. Биомедицинская химия, 61(2), 169-175..
См. также Протеомика Сплайсинг Словарь терминов биотехнологии
Примечания
Категория:Разделы биологии Категория:Белки Категория:Протеомика