Strukturna klasifikacija proteina, (-{SCOP}-), je baza podataka koja prvenstveno sadrži manualnu klasifikacija proteinskih strukturnih domena. Ona je bazirana na sličnosti njihovih aminokiselinskih sekvenci i tri-dimenzionih struktura. Originalno je objavljena 1995. i obično se ažurira jednom godišnje. Održavaju je Alexej Murzin i njegove kolege,.

Hijerarhijska struktura

SCOP sadrži četiri nivoa hijerarhijske strukturne klasifikacije:

klasa - generalna "strukturna arhitektura" domena nabor - slična organizacija regularne sekundarne strukture ali bez evidencije o evolucionoj povezanosti superfamilija - dovoljna strukturna i funkciona sličnost da se izvede zaključak o divergentnoj evolucijskoj vezi, mada homologija sekvenci ne postoji familija - sličnost sekvenci se može detektovati

Vidi još

-{CATH}- -{FSSP}- -{SUPERFAMILY}-

Literatura

Spoljašnje veze

Strukturna klasifikacija proteina -{pre-SCOP}- -{qSCOP — SCOP}- kvantifikovan strukturnim odnosima -{SUPERFAMILY}-

Категорија:Структура протеина Категорија:Протеински набори Категорија:Протеинска класификација Категорија:Биолошке базе података