Superfamilija (-{SUPERFAMILY}-) je baza podataka koja sadrži strukturnu i funkcionalnu anotaciju svih proteina i genoma.

Ova anotacija bazirana na kolekciji skrivenih Markovljevih modela, koji predstavljaju strukturne proteinske domene na nivou -{SCOP}- superfamilije. Grupe superfamilije formiraju domene koji imaju evolucione odnose. Anotacija je formirana skeniranjem proteinskih sekvenci kompletno sekvenciranih genoma koristeći skrivene Markovljeve modele.

Za svaki protein se može: Poslati sekvenca za -{SCOP}- klasifikaciju Razmatrati organizacija domena, poravnavanja sekvenci i detalji proteinskih sekvenci

Reference

Vidi još SCOP Pfam InterPro Proteinska familija Strukturni domen proteina

Spoljašnje veze -{SUPERFAMILY}- -{Spiricoil}-

Категорија:Протеинска класификација Категорија:Геномика Категорија:Биолошке базе података