IUPHAR/BPS Vodič za framakologiju je vebsajt otvorenog pristupa, koji deluje kao portal informacija o biološkim metama licenciranih lekova i drugih malih molekula. Vodič za parmakologiju (čija standardna skraćenicapri je GtoPdb) je razvijen kao zajednički poduhvat Međunarodne unije za bazičnu i kliničku farmakologiju (IUPHAR) i Britanskog farmakološkog društva (BPS). Ovaj projekat zamenjuje i proširuje originalnu 2009 IUPHAR bazu podataka (standardna skraćenica IUPHAR-DB). Cilj Vodiča za farmakologiju je da pruži koncizni pregled svih farmakoloških ciljeva, i da ih učini dostupnim svim članovima naučnih i kliničkih zajednica i zainterasovanog javnog mnjenja, sa linkovima ka detaljima za odabrani set ciljeva. Podaci obuhvataju farmakološke podatke, nomenklaturu ciljeva i gena, kao i obrađene hemijske informacije o ligandima. Dati su pregledi i kcomentari o svakoj familiji ciljeva, sa linkovima ka ključnim referencama.
Zaleđina i razvoj Vodič za farmakologiju je initicajalno bio dostupan na Internetu u decembru 2011, a dodatni materijal je objavljen jula 2012. Vodič održava tim kustosa baziranih na Edinburškom univerzitetu. Vodič za farmakologiju je razvila međunarodna mreža saradnika, koja obuhvata editore Konciznog vidiča za farmakologiju. Kao i u slučaju originalnog IUPHAR-DB, Komitet za nomenklaturu receptora i klasifikaciju lekova (NC-IUPHAR) Međunarodne unije za baznu i kliničku farmakologiju (IUPHAR), deluje kao naučni savetodavini i editoriski odbor za bazu podataka. Mreža od preko 700 specializovanih savetnika (organizovanih u ~60 potkomiteta) doprinosi ekspertizama i podacima. Trenutni principalni istraživač i nosilac stipendije GtoPdb projekta je prof. Jamie A. Davies. Razvoj i objavljivanje prve verzije GtoPdb 2012. godine je opisan u uvodniku objavljenom u British Journal of Pharmacology pod naslovom . IUPHAR-DB se više ne razvija i sadržaj tog sajta je sad dostupan u Vodiču za farmakologiju (IUPHAR-DB linkovi bi trebalo da budu preusmereni).
Kontent i svojstva Sledeće ciljne grupe su trenutno uvrštene u Vodič za farmakologiju: Katalitički receptori Enzimi G protein-spregnuti receptori Jonski kanali Kinaze Nuklearni receptori Transporteri Druge proteinske mete, uključujući proteine koji vezuju masne kiseline, sigma receptore i adiponektinske receptore
Informacije o grupama meta su podeljene u familije na osnovu klasifikacije, sa zasebnim stranama podataka za svaku familiju. Unutar svake strane, biološke mete su organizovane u spiskove tabela, pri čemu svaka tabela sadrži proteinsku i gensku nomenklaturu mete sa vezama ka bazama podataka genske nomenklature. Odabrani ligandi su navedeni zajedno sa vrednostima njihovih aktivnosti na datoj meti, uključujući agoniste, antagoniste, inhibitore i radioligande. Farmakološki podaci i reference su dati, i za svaki ligand je naveden hiperlink ka stranici liganda koja sadrži nomenklaturu i hemijsku strukturu ili peptidnu sekvencu, zajedno sa sinonimima i relevantnim linkovima ka bazama podataka. Vodič za farmakologiju isto tako sadrži spisak svih molekula liganda koji su uključen u sajt. Spisak je podeljen u kategorije, kao što su mali organski molekuli (uključujući sisarske metabolite, hormone i neurotransmitere), sintetičke organske molekule, prirodne produkte, peptide, neorganske molekule i antitela. Kompletan spisak svih odobrenih lekova koji su uvršteni u vebsajt je takođe dostupan sa spiska liganda. U toku je proširenje Vodiča za farmakologiju kojim se unose klinički podaci o metama i ligandima, kao i obrazovni resursi.
Funkcije pretrage vebsajta obuhvataju brze i napredne opcije pretrage, i pretrage receptora i liganda, uključujući podršku za strukture liganda koristeći hemijske strukture. Druga svojstva su vesti 'vrućih tema' i spisak nedavno definisanih parova receptora i liganda.
Sažeti vodič za farmakologiju Vodič za farmakologiju obuhvata onlajn bazu podataka otvorenog pristupa Konciznog vodiča za farmakologiju, koji se ranije zvao "Vodič za receptore i kanale" Ona je dostupna u HTML, PDF i štampanom formatu. Štampani pregled ove onlajn baze podataka je objavljen kao Koncizni vodič za farmakologiju 2015/2016, u obliku serije članaka koji su polugodišni dodaci u British Journal of Pharmacology.
Baze podataka Vodič za farmakologiju sadrži linkove na niz relevantnih resursa širom stranica o metama i ligandima. To važi za koncizne, kao i detaljne preglede. Mnogi od tih resursa održavaju recipročne linkove na relevantne strane Vodiča za frmakologiju.
HUGO komitet za gensku nomenklaturu Genomska informatika miša Genomska baza podataka pacova Ensembl UniProt Entrez PubChem ChemSpider ChEMBL ChEBI KEGG Mendelovsko nasleđivanje kod čoveka (OMIM) DrugBank Proteinska banka podataka (PDB)
Vidi još Međunarodna unija za bazičnu i kliničku farmakologiju Biološki cilj -{British Journal of Pharmacology}-
Reference
Spoljašnje veze IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY International Union of Basic and Clinical Pharmacology (IUPHAR) British Pharmacological Society (BPS) British Journal of Pharmacology Concise Guide to PHARMACOLOGY Wellcome Trust
Категорија:Биолошке базе података Категорија:Фармакологија Категорија:Фармаколошки класификациони систем