Куп Македоније у фудбалу у сезони 2006/07 одржава се петнаести пут у организацији Фудбалског савеза Македоније.
У шеснаестини финала која је играно у среду, 30. јула 2006. учествовала су 32 клуба, од тога 12 из Прве лиге Македоније, 12 из Друге лиге, и 8 клубова нижег ранга који су прошли предтакмичење.
Утакмице шеснаестине финала играју се по једноструком куп систему.(једна утакмица)
Утакмице осмине финала, четвртфинала и полуфинала играју се по двоструком Куп систему (две утакмице).
Финална утакмица се игра по једноструком куп систаму на Градском стадиону у Скопљу.
У случају нерешеног резултата код утакмица које се играју по једноструком куп систему у шеснаестини финала, одмах се изводе једанаестерци, а код финалне утакмице прво се играју два породужетка по 15 минута, па ако резултат и после тога остане нерешен изводе се једанаестерци.
Победник на утакмицма осмине финала, четвртфинала и полуфинала је екипа која је на обе утакмице дала више голова. Ако су екипе постигле исти број голова победник је екипа која је дала више голова у гостима У случају да је на обе утакмице постигнут истоветан резултат, победник се добија извођењем једанаестераца.
Куп Македоније 2006/07 је освојила пети пут екипа Вардара из Скопља
Победник Купа се пласира у Прво коло квалификација за УЕФА куп 2007/08..
Резултати Шеснаестина финала 30. јули Утак. Клуб, Место Резултат Клуб, Место 1 Тиквеш, Кавадарци 0 : 5 Македонија ЂП, Скопље 2. Новаци 0 : 6 Мађари Солидарност, Скопље 3. Локомотива Скопље 1 : 6 Ренова, Џепчиште 4. Илинден Скопље 2 : 1 Силекс, Кратово 5. Тиверија 0 : 6 Пелистер, Битољ |-align="center" | 6.||Осогово || 0 : 2 Башкими, Куманово |-align="center" | 7.|| Делчево || 0 : 2 прекидУтакмица прекинута при резултату 2:0 у корист Шкендија 79.Шкендија 79 Тетово |-align="center" | 8. || Металург, Скопље || 3 : 0|| Беласица, Струмица |-align="center" | 9. || Дрита, Боговиње || 0 : 0 (5:3) пенали ||Караорман, Струга |-align="center" | 10. || 11 Октомври, || 0 : 6 || Вардар, Скопље |-align="center" | 11. ||Новаци, || 0 : 2 ||Работнички Кометал, Скопље |-align="center" | 12. || Тетекс, Тетово|| 2 : 2 (3:4)) пенали ||Брегалница, Штип |-align="center" | 13.|| Гостивар || 2 : 1 || Напредок, Кичево |-align="center" | 14.||Турново || 1 : 3 || Победа, Прилеп |-align="center" | 15.|| Милано, Куманово ||2 : 1 ||Влазрими, Кичево |-align="center" | 16.||Дојранско Езеро ||2 : 3 ||Цементарница 55''', Скопље
Осмина финала Утакмице си игране 20. септембар и 18. октобар Утак. Клуб, Место Укупан резултат Клуб, Место 1. утак.2. утак. 1 Победа, Прилеп 3 : 0 Шкендија 79 Тетово 2 : 0 1 : 0 2. Вардар, Скопље 5 : 1 Металург, Скопље 4 : 1 1 : 0 3. Дрита, Боговиње 4 : 2 Брегалница, Штип 3 : 0 1 : 2 4. Гостивар 3 : 6 Ренова, Џепчиште 1 : 4 2 : 2 5. Милано, Куманово 4 : 3Башкими, Куманово2 : 1 2 : 2 6. Работнички Кометал, Скопље 5 : 4 Илинден Скопље 4 : 0 1 : 4 7. Македонија ЂП, Скопље 0 : 2 Цементарница 55, Скопље 0 : 2 0 : 0 8. Мађари Солидарност, Скопље 2 : 4 Пелистер, Битољ 2 : 2 0 : 2
Четвртфинале Утакмице си игране 1. новембар и 29. новембар Утак. Клуб, Место Укупан резултат Клуб, Место 1. утак. 2. утак. 1. Вардар, Скопље 4 : 2Цементарница 55, Скопље 4 : 1 0 : 1 2. Работнички Кометал, Скопље 1 : 2 Милано, Куманово 1 : 10 : 1 3. Дрита, Боговиње 3 : 7 Победа, Прилеп 2 : 1 1 : 6 4. Пелистер, Битољ, Куманово 2 : 2Пелистер се квалификовао по правилу гола постигнутог у гостима. Ренова, Џепчиште 0 : 1 2 : 1
Полуфинале Прве утакмице су игране 11. априла а реванши 2. маја Утак. Клуб, Место Укупан резултат Клуб, Место 1. утак. 2. утак. 1 Победа, Прилеп 3 : 1 Милано, Куманово2 : 1 1 : 0 2. Вардар, Скопље 3 : 2 Пелистер''', Битољ 2 : 1 1 : 1
Финале 24. мај Клуб, Место Резултат Клуб, Место Победа, Прилеп 1 : 2 Вардар, Скопље
Освајач Купа Македоније 2006/07Врдар5. Титула
Резултати освајача купа у УЕФА купу 2007/08.
РангКлуб Држава укупан рез.Држава Клуб 1. утак. 2. утак.УЕФА куп 2007/08.Прво коло кв.Вардар, Скопље 0 - 2 '''Анортозис, Фамагуста 0-10-1
Види још Фудбалски савез Македоније
Спољашње везе Званични сајт Фудбалског савеза Македоније
Категорија:Куп Македоније у фудбалу Категорија:Сезона 2006/07. у македонском фудбалу