Біофізичні методи — набір методів, які використовуються для дослідження фізичних властивостей біологічних систем.
Основні методи Математичне моделювання — методи теоретичного опису біологічних систем. Круговий дихроїзм — метод виявлення хіральних груп в молекулах, визначення вторинної структури білків. Обчислювальна хімія — застосування обчислювальних методів для визначення структури і динаміки молекул (наприклад, молекулярна динаміка). Подвійна поляризаційна інтерферометрія — аналаітичний метод, який застосовується для вимірювання конформації і активності широкого класу біомолекул в реальному часі. Електрофоретичні методи — використовуються для визначення маси, заряду, або взаємодій між біологічними молекулами. Ізотермальна титрувальна калориметрія — метод для вимірювання теплових ефектів, що є результатом взаємодій між молекулами. Оптичні щипці або Магнітні щипці — дозволяють маніпулювати одиничними молекулами. Використовують для дослідження нуклеїнових кислот, особливо взаємодію ДНК з білками (такими як гелікази чи полімерази).
Центрифугування і ультрацентрифугування — методи вивчення форми і маси молекул. Patch-clamp - метод локальної фіксації потенціалу клітинної мембрани. Дозволяє вимірювати різницю електричних потенціалів через поодинокі йонні канали в мембрані. Мікроскопія Оптична мікроскопія Електронна мікроскопія — метод, що використовується для отримання зображень високої якості. Лазерна конфокальна мікроскопія — метод, що використовується для отримання зображень та відео флуорисцентних молекул. Силова мікроскопія — метод, що дозволяє отримувати зображення окремих атомів. Денситометрія електронної хмарки — метод, що дозволяє отримувати зображення окремих молекул, атомів та хімічних зв'язків. Спектроскопія Спектрофотометрія — вимірювання проходження світла через різні розчини чи речовини за різної довжини хвилі. Один з видів методу — колориметрія. Інфрачервона спектроскопія Оптична спектроскопія Ультрафіолетова спектроскопія Спектроскопія одиничних молекул — клас методів, які достатньо чутливі щоб відстежувати поодинокі молекули, часто включають флуоресцентну детекцію. Мас-спектрометрія — метод визначення молекулярної маси, хімічного складу, фазового складу та молекулярної структури речовин. ЯМР-спектроскопія — метод вивчення структури і динамічних властивостей молекул (див. наприклад ЯМР-спектроскопія білків). Електронний парамагнітний резонанс — використовується для визначення концентрацій певних молекул. Флуоресцентна спектроскопія — метод, що використовується для знаходження структурних перебудов молекул та взаємодій між ними. Силова спектроскопія — використовується для визначення механічних властивостей окремих молекул або макромолекулярних ансамблів з допомогою кантиліверу, фокусованого лазерного проміння, або магнітних полів. Хроматографічні методи — методи очищення і аналізу біологічних молекул. Кристалографія рентгенівськими променями — метод вивчення структури з атомною точністю.
Див. також Біофізика Біометрія
en:Outline of biophysics#Biophysical techniques