Молекуля́рні сполу́ки (, ) — сполуки, що утворюються з формально валентно-насичених молекул завдяки силам міжмолекулярної взаємодії. У молекулярні сполуки (комплекси) можуть входити іони, вільні радикали, іон-радикали, а також молекули в збудженому стані; до молекулярних комплексів належать й комплекси з водневим зв'язком. Молекулярні сполуки складаються з груп атомів (молекул) із значно меншими відстанями між атомами всередині однієї групи, ніж між аналогічними атомами різних груп. Сили всередині молекул значно перевищують сили міжмолекулярного зв’язку. Внутрішньомолекулярні сили зазвичай ковалентні або іонні, міжмолекулярні завжди ван-дер-ваальсові.
Молекулярні сполуки використовують як каталізатори, в аналіт. хімії, електроніці, гідрометалургії та ін. Син. — молекулярні комплекси, донорно-акцепторні комплекси.
Див. також Змішані вищі молекулярні сполуки