Udział w ludobójstwie thumb|right|Kościół parafialny Świętej Rodziny w Kigali, gdzie Wenceslas Munyeshyaka był wikariuszem Świadkowie zeznawali o masowych egzekucjach odbywających się w dniach od 17 do 22 kwietnia 1994 w parafii Świętej Rodziny w Kigali, gdzie Munyeshyaka był wtedy wikariuszem. W kwietniu i maju 1994 miał on wielokrotnie brać udział w selekcji Tutsich do zamordowania, bezczynnie obserwować jak umierają z pragnienia, donosić na osoby pomagające Tutsim a także dopuścić się gwałtów na szukających schronienia kobietach. Wenceslas Munyeshyaka był fotografowany w trakcie ludobójstwa w stroju wojskowym, z pistoletem i granatami przy pasie.
Procesy Przeciwko Wenceslasowi Munyeshyace odbyły się trzy postępowania: jedno prowadzone przez rwandyjski sąd wojskowy w Kigali, drugie prowadzone przez prokuraturę francuską i trzecie przez Międzynarodowy Trybunał Karny dla Rwandy, przekazane po jakimś czasie jurysdykcji francuskiej.
Proces przed sądem francuskim i postępowanie Międzynarodowego Trybunału Karnego dla Rwandy 25 lipca 1995 roku sędzia śledczy rozpoczął śledztwo przeciwko Wenceslasowi Munyeshyace w sprawie ludobójstwa, zbrodni przeciwko ludzkości oraz udziału w grupie mającej na celu popełnienie tych przestępstw.