Wkrótce na wniosek prezesa braniewskiego Sądu Okręgowego, sędziego Konrada Bobrowskiego, minister sprawiedliwości rozporządzeniem z 14 grudnia 1945 przeniósł siedzibę sądu okręgowego z Braniewa do Pasłęka (pozostawiając w Braniewie sąd grodzki). Pasłęk był położony bliżej centrum okręgu, ponadto posiadał już połączenia kolejowe z innymi miastami Okręgu, a zwłaszcza z Olsztynem. Faktycznie przeniesienie Sądu Okręgowego z Braniewa do Pasłęka miało miejsce 20 grudnia 1945.
XIX-wieczny gmach braniewskiego sądu zamierzano odbudować już w roku 1948Remont gmachu sądu w Braniewie. Brak fachowców opóźnia tempo odbudowy, Życie Olsztyńskie : pismo ziemi warmińsko-mazurskiej, 23 grudnia 1947, nr 237, s. 5, mimo to do 1959 roku stał jednak nieużytkowany, przez co niszczał i popadał w dalszą ruinę. Zniszczeniu uległy ceglane ściany i stropy. Od tegoż roku przystąpiono do remontu obiektu. W części skrzydła północnego wykonano naprawę dachu nad korytarzami, położono stropy Kleina oraz częściowo uzupełniono cegłą ściany. W latach 1969–1974 miał miejsce generalny remont budynku, podczas którego odbudowano również część skrzydła południowego. Wówczas, w 1974 roku, powróciła do tego budynku siedziba sądu powiatowego w Braniewie.