5 września jednostka wypłynęła na pierwszy patrol pod banderą Wolnych Francuzów, kierując się w rejon ławicy Dogger Bank. Z powodu braku min okręt nie odniósł sukcesu, powracając do bazy w Dundee po 15 dniach pobytu w morzu. Drugi bezowocny patrol „Rubis” odbył między 5 a 18 października, operując w pobliżu Stavangeru. Trzecia misja bojowa, rozpoczęta 31 października, polegała początkowo na dostarczeniu w okolice Bergen agenta norweskiego wywiadu, który opuścił pokład okrętu 3 listopada; następnie „Rubis” patrolował do 12 listopada wody między Bergen a Haugesund, wracając do Dundee 14 listopada. Czwarty patrol, równie bezowocny jak trzy poprzednie, został przeprowadzony w dniach 1–18 grudnia 1940 roku, a okręt operował na północ od Bergen.
1941 rok Po powrocie z rejsu okręt trafił do stoczni na czteromiesięczny remont, zakończony 22 marca 1941 roku. W jego trakcie przystosowano okręt do przenoszenia min produkowanych przez koncern Vickers–Armstrong (w porównaniu do oryginalnych Sautier-Harlé miały mniejsze rozmiary i masę ładunku wybuchowego oraz brak możliwości regulacji długości minliny z wnętrza okrętu;