Cmentarz został zniszczony przez Niemców podczas II wojny światowej (w 1942 na teren cmentarza wjechały niemieckie czołgi i inne pojazdy pancerne kryjąc się przed radzieckim nalotem, w 1944 w rejonie Powązek trwały zacięte walki w czasie powstania warszawskiego).
Najstarsze zachowane nagrobki znajdują się obecnie na lewo od wejścia, przed budynkiem administracyjnym.
W 1984 nekropolia została wpisana do rejestru zabytków.
Pochowani (m.in.)
Aleksander Achmatowicz (zm. 1944) – prawnik, minister sprawiedliwości w rządach Krymu i Litwy Środkowej, senator II RP. Osman Achmatowicz (zm. 1988) – chemik, profesor Uniwersytetu Warszawskiego, prezes Komitetu Budowy Meczetu w Warszawie. Konstanty Bajraszewski (zm. 1955) – adwokat. Mounir Bouamrane (zm. 2004) – montażysta dźwięku i obrazu pochodzenia algierskiego. Jerzy Edigey (zm. 1983) – adwokat, działacz społeczny, autor powieści kryminalnych. Bekier Eksanow (zm. 1974) – imam warszawski. Zeryf Eksanow (zm. 1951) – imam warszawski. Hussein Mohamed Hassan (zm. 2020) – doktor nauk medycznych, konsul honorowy RP w Sudanie. Veli bek Jedigar (zm. 1971) – książę Azerbejdżanu, oficer kawalerii WP. Israfil Bek Jedigar (zm. 1938) – major Wojska Polskiego. Aleksander Jeljaszewicz (zm.