Druga faza operacji rozpoczęła się 1 października. Komuniści zaczęli odcinać połączenia pomiędzy poszczególnymi garnizonami oraz ich komunikację z portami w Yingkou, Huludao – skąd można było wysadzać nowe dywizje. Gongzhuling położone mniej więcej w połowie trasy między Shenyangiem a Changchunem wpadło w ręce komunistów 4 października. Następnego dnia ChAL-W zdobyła położone na południe od Sipingu miasta Changtu i Kaiyuan, ale pod Tielingiem ich marsz zatrzymał gen. Liao Yaoxiang, absolwent francuskiej szkoły wojskowej w Saint-Cyr i niegdyś dowódca 6 Armii w Birmie, a obecnie dowodzący 4 Grupą Armii w stolicy Mandżurii. Między Shenyangiem a wybrzeżem ANR wyparto z Dashiqiao i Haicheng. Udało się jednak utrzymać Yingkou ale na niektórych odcinkach komuniści dotarli do morza.
Chen Cheng szybko zebrał się jednak do kontruderzenia. Ściągnął on jedną dywizję lądem z prowincji Rehe a dwie morzem przez Huludao. 1 listopada ANR odbiła miasto Gongzhuling – tym samym przywracając połączenie pomiędzy Sipingiem a Shenyangiem. 13 listopada nacjonaliści zdobyli duże miasto Jilin.