Obecnie w Nankinie stoi mauzoleum ofiar masakry. Po wojnie kontrowersje zaczęło wzbudzać przedstawianie zarówno tej, jak i innych zbrodni wojennych w japońskich podręcznikach do historii. Po wygraniu wyborów w 1955 przez Partię Liberalno-Demokratyczną w Japonii zakazano pisania o zbrodni nankińskiej w szkolnych podręcznikach do historii. Spotkało się to z ostrą reakcją ze strony Chin i Tajwanu. W kwietniu 2005 doszło w mieście Shenyang (północno-wschodnie Chiny) do antyjapońskich demonstracjiChiny: Trwają antyjapońskie protesty., podczas których żądano wycofania obowiązujących w japońskich szkołach podręczników do historii, gdyż te przedstawiają fałszywy obraz wojny.
Masakra nankińska w kulturze popularnej 1987 – film Masakra w Nankinie – dramat w reżyserii Guanquna Luo. 1995 – film Hei tai yang Nan Jing da tu sha chińskiego reżysera Tun Fei Mou. 2008 – film Dzieci z Jedwabnego Szlaku. 2009 – film Miasto życia i śmierci – dramat wojenny w reżyserii Chuan Lu. 2010 – amerykańska grupa thrashmetalowa Exodus wydała album Exhibit B: The Human Condition, na którym znalazł się utwór „Nanking”, bezpośrednio nawiązujący do masakry. 2011 – film Kwiaty wojny – dramat wojenny w reżyserii Zhanga Yimou. 2018 – Wojna Makowa – książka autorstwa Rebeki F. Kuang.