Rada Naczelna Federacji liczy 17 przedstawicieli różnych kościołów protestanckich.
Kościoły członkowskie Armia Zbawienia Armée du salut (ADS) - razem z Belgią Cygańska Misja Ewangeliczna Francji (METF) Federacja Ewangelicznych Kościołów Baptystów Francji (FEEB) Federacja Koreańskich Kościołów we Francji (FECF) Hillsong Paryż (zielonoświątkowcy) Kościół Adwentystów Dnia Siódmego we Francji Kościół Boży we Francji (zielonoświątkowcy) Kościół Nazarejczyka Kościół Zielonoświątkowy Francji (EPF) Malgaski Kościół Protestancki we Francji (EPMF) Międzynarodowy Kościół Poczwórnej Ewangelii (zielonoświątkowcy) Narodowa Unia Niezależnych Ewangelicznych Kościołów Reformowanych Francji (UNEPREF) Popularna Misja Ewangeliczna Francji (MPEF) Społeczność Kościołów Tradycji Afrykańskiej we Francji (FRC) Społeczność Kościołów Obszaru Frankofonii (FEAC) Społeczność Ewangelicznych Kościołów Protestanckich (CEPEE) Unia Ewangelicznych Kościołów Protestanckich Horizon Unia Ewangelicznych Kościołów Przebudzeniowych (UEER) Unia Kościoła Ewangelicko-Metodystycznego Francji (UEEMF) Unia Kościołów Protestanckich Alzacji i Lotaryngii (UEPAL) Unia Niezależnych Kościołów Zielonoświątkowych (UNEPI) Unia Ormiańskich Kościołów Ewangelicznych