W 1962, wprowadzono nowy plan mobilizacyjny PM–62. Zakładał on na wypadek wojny znaczne rozwiniecie jednostki. Zgodnie z etatem czasu „P”, na dzień 1 lipca 1965 Brygada liczyła 1570 żołnierzy, a etat czasu „W” przewidywał 3247 żołnierzy. W ramach zadań mobilizacyjnych jednostka mobilizowała dywizjon OP Kołobrzeg i samodzielną eskadrę lotnictwa rozpoznawczego WOP.
9 czerwca 1963 społeczeństwo województwa koszalińskiego ufundowało nowy sztandar dla Bałtyckiej Brygady WOP, wręczenia dokonał dowódca WOP gen. bryg. Eugeniusz Dostojewski.
31 lipca 1964 rozformowano strażnice WOP: Stilo (budynek strażnicy przekazano Kaszubskiej Brygadzie WOP) i Rowy a w jej budynkach zorganizowano ćwiczebną strażnicę WOP.
15 sierpnia 1964 Graniczna Placówka Kontrolna Łeba oraz strażnice WOP: Karwia, Biała Góra i Łeba wraz z odcinkami przekazano do Kaszubskiej Brygady WOP.
30 sierpnia 1964 rozformowany został sztab batalionu w Lęborku a obiekty przekazano do Kaszubskiej Brygady WOP, zreorganizowana została Szkoła Podoficerska i z dniem 1 stycznia 1965 rozpoczęła szkolenia podoficerów radiolokacji.