O 4:50 6 kwietnia batalion KBW podzielony na cztery grup, zajął pozycje bojowe. Okrążono Gorajec wraz z przysiółkami. O 5:00 nastąpił atak. Rozpoczęto od ostrzelania wsi z moździerza, następnie przeprowadzono atak piechoty. O 6:10 wieś została zajęta. Wojsko przebywało w Gorajcu do 10:00. Około 60 osób rozstrzelano na terenie jednego z gospodarstw. Wieś została podpalona, a w budynkach żywcem spłonęły kolejne osoby. Działaniom wojska towarzyszyła akcja polskiej ludności cywilnejRaport ze śledztwa IPN, sygn. akt S 55/03/Zk. Na rzecz wojska zagrabiono majątek cywilny mieszkańców wsi. W czasie akcji zginęło 174 osoby, 32 kobiety, 35 dzieci oraz 19 osób powyżej 60 lat.
Śledztwo IPN IPN w przeprowadzonym śledztwie uznało, że akcja była samowolnym działaniem żołnierzy, a celem dowództwa była jedynie likwidacja ukraińskich sił zbrojnych, w związku z czym „czyny (...) nie zawierają znamion zbrodni komunistycznej”.