W czerwcu 1916 roku Ernest Troubridge otrzymał awans do stopnia wiceadmirała (Vice-Admiral) i dołączył do nowo formowanej w Salonikach armii serbskiej. Uczestniczył w kampanii bałkańskiej do końca I wojny światowej, dowodząc między innymi flotyllą kanonierek na Dunaju.
Ostatnie lata Na początku 1919 roku powrócił do Wielkiej Brytanii i awansował do stopnia admirała (Admiral). Jego doświadczenie z czasu pobytu na Bałkanach spowodowało, że zaproponowano mu stanowisko przewodniczącego międzynarodowej komisji nadzorującej swobodę żeglugi na Dunaju. Pełnił tę funkcję, z przerwami, do marca 1924 roku. Po przejściu na emeryturę osiadł we francuskim Biarritz, gdzie zmarł 28 stycznia 1926 roku.
Odznaczenia Kawaler Komandor Orderu św. Michała i św. Jerzego (Wielka Brytania) Kawaler Królewskiego Orderu Wiktoriańskiego (Wielka Brytania) Srebrny Medal Royal Human Society (Wielka Brytania) Krzyż Wojenny (Czechosłowacja) Krzyż Wojenny (Francja) Wielki Komandor Orderu Zbawiciela (Grecja) Order Wschodzącego Słońca (Japonia) Krzyż Wielki Orderu Gwiazdy (Rumunia) Krzyż Wielki Orderu Orła Białego (Serbia) Wielki Oficer Orderu Gwiazdy Jerzego Czarnego (Serbia) Krzyż Wielki Orderu Świętych Maurycego i Łazarza (Włochy)