Czartoryski zostawał jednocześnie polskim ministrem spraw zagranicznych i polskim ambasadorem we Francji.
Kompetencje Agent główny miał występować wobec rządów innych państw jako przedstawiciel rządu uznanego przez całe społeczeństwo polskie, jako przedstawiciel podziemnego Państwa Polskiego. W świetle danej instrukcji agenci powinni podkreślać, że kwestia polska jest kwestią prawa, sprawiedliwości i porządku a przywrócenie Polski dla żadnego z państw nie byłoby w prawdziwym rozumieniu rzeczy szkodliwym i groźnym. Agenci zostali zobowiązani do składania Rządowi Narodowemu przynajmniej raz w miesiącu systematycznych raportów. Instrukcja rządowa z 17 sierpnia 1863 roku powierzała agentom dyplomatycznym obowiązki opieki konsularnej nad przebywającymi w danym kraju Polakami.
Struktura Agencja podporządkowana została Wydziałowi Spraw Zagranicznych Rządu Narodowego. Podlegały jej 4 wydziały: stosunków z innymi agencjami (Wydział Dyplomatyczny) wydział drukowy (propagandy) wydział kasy i kontroli wydział krajowy i zagraniczny oraz sekretariat.