17 czerwca generał Dowbor-Muśnicki rozkazał „kadrową kompanię kolejową przy II batalionie saperów rozwinąć w samodzielny batalion kolejowy podlegający Inspektorowi Wojsk Technicznych”. Dowódcą batalionu został mianowany porucznik RugeRozkaz dzienny Nr 164 DG SZ w b. zaborze pruskim z 17 czerwca 1919 roku..
Cel tworzenia baonu był taki, aby stłumić w razie potrzeby strajk kolejowy, grożący ze strony urzędników niemieckich, pozostałych w Wielkopolsce. Następnie miała naprawiać uszkodzone linie kolejowe i mosty na froncie Wielkopolskim.
15 czerwca 1919 roku oddział liczył około 500 szeregowców, zorganizowanych w trzy kompanie. Z uwagi na brak wystarczającej liczby oficerów ich funkcje przejęli podoficerowie. W lipcu 1919 roku baon rozpoczął szkolenie w zakresie służby wodnej, budowy kolei, mostów drewnianych, pilotowaniu, ustawianiu kafarów żelaznych i drewnianych. W sierpniu 1919 roku została utworzona czwarta kompania.