Armadilo ponavljanje-sadržavjući X- 6-vezani protein kod čovjeka kodiran je genom ARMCX6, koji se nalazi na X-hromosomu.
Jedan je od šest armadilo ponavljanja –sadržavajući X-vezani proteinea: ARMCX1, ARMCX2, ARMCX3, ARMCX4, ARMCX5 i ARMCX6 (ovaj protein)).
Funkcija ovog proteina još uvijek nije poznata.
Proteinska sekvenca 1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 301 FMSLFIRNGN REILLETPAP
Homologija ARMCX6 je konzerviran kod mnogih eukariotskih organizam.
Ortolozi Taksonomsko imeUobičajeno imeNCBI-ulazSličnost ekvence (%)Dužina (AAs)Komentar Homo sapiensČovjek100%300 Armadillo ponavljanje sadržavajući X-vezani 6 Macaca mulattaRezus makak97.0%300 Pretpostavljeno: sličan armadilo ponavljanje sadržavajućem X-vezanom 6 (H. sapiens)-olika izoforma 1 Equus caballusKonj 90,0%300Pretpostavljeno: sličan armadilo ponavljanje sadržavajućem X-vezanom 6 Danio rerioZebrica84,0%301Sličan RIKEN cDNK-u 0610039K22 Mus musculusMiš97,7%393 Armadilo ponavljanje sadržavajući X-vezani 6 (H. sapiens)-oliki Bos taurusGovedo83,0%301 Armadilo ponavljanje sadržavajući X-vezani (H. sapiens)-oliki 6 Mus musculusMiš82.0%301armadillo repeat containing, X-linked 6 Takifugu rubripesTetradontoidea66,0%818aril hidrokarbon-receptor 2C Caenorhabditis elegansC. elegans50,0%332 Serpentinski receptor, član porodice klase H (srh-216) Saccharomyces cerevisiaeKvasac70,0%910Hul5p Gallus gallusKokoš52.0%317Pretpostavljeno: hipothetski protein
Sekundarna struktura Predviđa se da je sekundarna struktura ARMCX6 slična cijanazi. Poređenje dvije sekvence prikazano je ispod.SDSC Biology Workbench 2.0 10 20 30 40 ....*....|....*....|....*....|....*....|....*.. ARMCX6 231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 277 1DW9_A 19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65 + + ++ + + + + + + + + + + ++++
Ekspresija Podaci o mikromreži pokazuju da je ARMCX6 izrazito izražen u najranijim fazama spermatogeneze kod miševa.
Reference
Vanjski linkovi
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu X Kategorija:Armadillo-ponavljanje-sadržavajući proteini