Elongacijski faktor 3 sličan RNK-polimerazi II je protein koji je kod ljudi kodiran genom ELL3.
Međunarodni konzorcij za radijacijsko mapiranje locirao je gen ELL3 na hromosomu 15 (RH44309).
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 397 aminokiselina, a molekulska težina 45.361 Da..
1020304050 MEELQEPLRGQLRLCFTQAARTSLLLLRLNDAALRALQECQRQQVRPVIA FQGHRGYLRLPGPGWSCLFSFIVSQCCQEGAGGSLDLVCQRFLRSGPNSL HCLGSLRERLIIWAAMDSIPAPSSVQGHNLTEDARHPESWQNTGGYSEGD AVSQPQMALEEVSVSDPLASNQGQSLPGSSREHMAQWEVRSQTHVPNREP VQALPSSASRKRLDKKRSVPVATVELEEKRFRTLPLVPSPLQGLTNQDLQ EGEDWEQEDEDMDPRLEHSSSVQEDSESPSPEDIPDYLLQYRAIHSAEQQ HAYEQDFETDYAEYRILHARVGTASQRFIELGAEIKRVRRGTPEYKVLED KIIQEYKKFRKQYPSYREEKRRCEYLHQKLSHIKGLILEFEEKNRGS
Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Pretragom baze podataka EST, Miller et al. (2000) identificirali su sekvence koje pokazuju visoku homologiju sa C-terminalnim sekvencama ELL i ELL2 . Koristeći strategiju zasnovanu na PCR-u, klonirali su ljudsku cDNA pune dužine, koju su označili kao ELL3. Izvedeni približno 400-aminokiselinski protein dijeli oko 50% identiteta sekvence s ELL i ELL2. Northern blot analizom otkriven je transkript od 2 kb eksprimiran isključivo u sjemenicima. Studije imunofluorescencije lokalizirale su ELL3 u jedru. Funkcija gena Miller et al. (2000) utvrdili su da ELL3, poput ELL i ELL2, može povećati katalitsku brzinu izduživanja transkripcije RNK-polimerazom II.Miller, T., Williams, K., Johnstone, R. W., Shilatifard, A. Identification, cloning, expression, and biochemical characterization of the testis-specific RNA polymerase II elongation factor ELL3. J. Biol. Chem. 275: 32052-32056, 2000. PubMed: 10882741
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika