Visokomobilni protein grupe 20A je protein koji je kod ljudi kodiran genom HMG20A.
Sumoy et al. (2000) potvrdili su mapiranje gena HMG20A u hromosomu 15q24, fluoroscentnom in situ hibridizacijom i hibridnom radijacijskom analizom.
Kloniranje i ekspresija Pretragom baze podataka EST pomoću sekvence dobijene iz klona na hromosomu 15q24, Sumoy et al. (2000) identificirali su novog člana porodice HMG, kojeg su označili kao HMG20A. cDNK HMG20A pune dužine kodira izvedeni protein od 347 aminokiselina. Northern blot analizom otkriveni su dvas glavna transkripta od približno 4 i 9 kb i jedva uočljivi transkript od 1,5 kb. Transkript od 4 kb eksprimira se gotovo posvuda, sa najvećom ekspresijom u slezeni, sjemenicima i srcu i nižim nivoima u leukocitima periferne krvi. Ekspresija mozga je uglavnom jednolična, sa većom ekspresijom u malom mozgu i nižim nivoima u kičmenoj moždini u subtalamusnom jezgru. Transkript od 9 kb različito se eksprimira u slezini, testisima, leukocitima i mozgu i jedva ga je moguće otkriti u drugim tkivima.
Pored toga, Sumoy et al. (2000) utvrdili su da gen HMG20A sadrži 10 egzona.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 47 aminokiselina, a molekulska težina 40.144 Da.. 1020304050 MENLMTSSTLPPLFADEDGSKESNDLATTGLNHPEVPYSSGATSSTNNPE FVEDLSQGQLLQSESSNAAEGNEQRHEDEQRSKRGGWSKGRKRKKPLRDS NAPKSPLTGYVRFMNERREQLRAKRPEVPFPEITRMLGNEWSKLPPEEKQ RYLDEADRDKERYMKELEQYQKTEAYKVFSRKTQDRQKGKSHRQDAARQA THDHEKETEVKERSVFDIPIFTEEFLNHSKAREAELRQLRKSNMEFEERN AALQKHVESMRTAVEKLEVDVIQERSRNTVLQQHLETLRQVLTSSFASMP LPGSGETPTVDTIDSYMNRLHSIILANPQDNENFIATVREVVNRLDR Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Reference
Dopunska literatura
V anjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika