Nabijeni multivezikulski tjelesni protein 4a je protein koji je kod ljudi kodiran genom CHMP4A.
Analizom genomske sekvence, Katoh et al. (2003) locirali su gen CHMP4A na hromosomu 14, sekvenca 14q11.2.Katoh, K., Shibata, H., Suzuki, H., Nara, A., Ishidoh, K., Kominami, E., Yoshimori, T., Maki, M. The ALG-2-interacting protein Alix associates with CHMP4b, a human homologue of yeast Snf7 that is involved in multivesicular body sorting. J. Biol. Chem. 278: 39104-39113, 2003. PubMed: 12860994
Opis CHMP4A pripada porodici proteina koji modificiraju hromatin/nabijeni multivertikulskni tjelesni protein (CHMP). Ovi proteini su komponente ESCRT-III (endosomni kompleks za sortiranje potreban za transport III), kompleksa koji je uključen u razgradnju proteina površinskih receptora i stvaranje endocitnih multivikulnih tijela (MVB). Neki CHMP imaju i jedsrnu i citoplazmatsku/ vezikulsku distribuciju, a jedan takav CHMP, CHMP1A, potreban je i za stvaranje MVB i za regulaciju napredovanja ćelijskog ciklusa (Tsang et al., 2006).Tsang, H. T. H., Connell, J. W., Brown, S. E., Thompson, A., Reid, E., Sanderson, C. M. A systematic analysis of human CHMP protein interactions: additional MIT domain-containing proteins bind to multiple components of the human ESCRT III complex. Genomics 88: 333-346, 2006. PubMed: 16730941
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 222 aminokiseline, a molekulska težina 25.098 Da.
1020304050 MSGLGRLFGKGKKEKGPTPEEAIQKLKETEKILIKKQEFLEQKIQQELQT AKKYGTKNKRAALQALRRKKRFEQQLAQTDGTLSTLEFQREAIENATTNA EVLRTMELAAQSMKKAYQDMDIDKVDELMTDITEQQEVAQQISDAISRPM GFGDDVDEDELLEELEELEQEELAQELLNVGDKEEEPSVKLPSVPSTHLP AGPAPKVDEDEEALKQLAEWVS
Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Korištenjem N-terminalne regije ALIX (PDCD6IP; 608074) kao sonde na 2-hibridnom skriningu kvasca u cDNK biblioteci HeLa ćelija, Katoh et al. (2003) klonirali su CHMP4A. Izvedeni protein od 223 aminokiseline ima tri područja sa upredenom zavojnicom, baznu polovihu N-kraja i kiselu polovinu C-kraja.Katoh, K., Shibata, H., Suzuki, H., Nara, A., Ishidoh, K., Kominami, E., Yoshimori, T., Maki, M. The ALG-2-interacting protein Alix associates with CHMP4b, a human homologue of yeast Snf7 that is involved in multivesicular body sorting. J. Biol. Chem. 278: 39104-39113, 2003. PubMed: 12860994
Analizom Northern blot-a, Katoh et al. (2004) otkrili su transkript CHMP4A od 1 kb u svim ispitivanim tkivima, s najvećom ekspresijom u srcu i umjerenom u skeletnim mišićima, bubrezima i jetri.Katoh, K., Shibata, H., Hatta, K., Maki, M. CHMP4b is a major binding partner of the ALG-2-interacting protein Alix among the three CHMP4 isoforms. Arch. Biochem. Biophys. 421: 159-165, 2004. [PubMed: 14678797 PCR-om ljudske biblioteke cDNK melanoma, Lin et al. (2005) klonirali su CHMP4A, kojeg su označili SNF7-1. Identificirali su dva motiva PxxP u blizini C-kraja CHMP4A. Northern blot analizom otkrivena je ekspresija CHMP4A u svim ispitivanim tkivima, s najvišim nivoima u bubrezima, jetri, skeletnim mišićima i srcu.
Funkcija 2-hibridnom analizom kvasca, Katoh et al. (2003) otkrili su da je CHMP4A komunicirao s ALIX-om. Lin et al. (2005) otkrili su da je prekomjerno eksprimiran SNF7-1 povezan sa ćelijskim membranama COS-7 i poremetio normalnu multivertikulnu biogenezu tijela. N-terminalna polovina SNF7-1 lokalizirala se na membranama i stvorila polimere otporne na deterdžent, dok se C-terminalna polovina pridružila ESCRT-III komponenti SKD1 (VPS4B).Lin, Y., Kimpler, L. A., Naismith, T. V., Lauer, J. M., Hanson, P. I. Interaction of the mammalian endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III protein hSnf7-1 with itself, membranes, and the AAA+ ATPase SKD1. J. Biol. Chem. 280: 12799-12809, 2005. Note: Erratum: J. Biol. Chem. 281: 38966 only, 2006. PubMed: 15632132
Tsang et al. (2006) izveli su sistematsku 2-hibridnu analizu kvaščevih i ljudskih komponenata ESCRT-III, uključujući CHMP4A. CHMP4A je komunicirao s proteinom ESCRT-III VPS4A i s molekulom za transdukciju signala CC2D1A. U S. cerevisiae, ESCRT-III se sastoji od Vps20, Snf7, Vps24 i Vps2, koji se sastavljaju tim redoslijedom i njihovo rastavljanje zahtijeva se ATPaza Vps4. Wollert et al. (2009) rekonstituirali i vizualizirali fluorescentnom mikroskopijom ESCRT-III, zavisno pupanje i cepanje intralumenskih vezikula u gigantske unilamelske vezikule. Pokazali su da su za odvajanje intralumenskih vezikula dovoljne tri podjedinice ESCRT-III, Vps20, Snf7 i Vps24. Vps2, ESCRT-III podjedinica odgovorna za regrutiranje Vps4 i ATPazne aktivnost Vps4 bile su potrebne za reciklažu ESCRT-III i podržale su dodatne krugove pupanja. Minimalni skup ESCRT-III i Vps4 proteina sposobnih za višestruke cikluse odvajanja vezikula odgovara drevnom skupu ESCRT proteina, konzerviranih od arheja do životinja.Wollert, T., Wunder, C., Lippincott-Schwartz, J., Hurley, J. H. Membrane scission by the ESCRT-III complex. Nature 458: 172-177, 2009. PubMed: 19234443 Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika