Eksportin-4 je protein koji je kod ljudi kodiran genom XPO4. Citogenetička lokacija ovog gena je na hromosomu 13, sekvenca: 13q12.11, a genomske koordinte (GRCh38): 13:20,777.328 – 20,902.773 bp (prema NCBI).
XPO4 pripada velikoj porodici karioferina, koji posreduju u transportu proteina i drugog tereta između jedarnog i citoplazmatskog odjeljka (Lipowsky et al., 2000).Lipowsky, G., Bischoff, F. R., Schwarzmaier, P., Kraft, R., Kostka, S., Hartmann, E., Kutay, U., Gorlich, D. Exportin 4: a mediator of a novel nuclear export pathway in higher eukaryotes. EMBO J. 19: 4362-4371, 2000. PubMed: 10944119
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.154 aminokiseline, a molekulska težina 130.139 Da..
1020304050 MMAAALGPPEVIAQLENAAKVLMAPPSMVNNEQRQHAEHIFLSFRKSKSP FAVCKHILETSKVDYVLFQAATAIMEAVVREWILLEKGSIESLRTFLLTY VLQRPNLQKYVREQILLAVAVIVKRGSLDKSIDCKSIFHEVSQLISSGNP TVQTLACSILTALLSEFSSSSKTSNIGLSMEFHGNCKRVFQEEDLRQIFM LTVEVLQEFSRRENLNAQMSSVFQRYLALANQVLSWNFLPPNLGRHYIAM FESSQNVLLKPTESWRETLLDSRVMELFFTVHRKIREDSDMAQDSLQCLA QLASLHGPIFPDEGSQVDYLAHFIEGLLNTINGIEIEDSEAVGISSIISN LITVFPRNVLTAIPSELFSSFVNCLTHLTCSFGRSAALEEVLDKDDMVYM EAYDKLLESWLTLVQDDKHFHKGFFTQHAVQVFNSYIQCHLAAPDGTRNL TANGVASREEEEISELQEDDRDQFSDQLASVGMLGRIAAEHCIPLLTSLL EERVTRLHGQLQRHQQQLLASPGSSTVDNKMLDDLYEDIHWLILVTGYLL ADDTQGETPLIPPEIMEYSIKHSSEVDINTTLQILGSPGEKASSIPGYNR TDSVIRLLSAILRVSEVESRAIRADLTHLLSPQMGKDIVWFLKRWAKTYL LVDEKLYDQISLPFSTAFGADTEGSQWIIGYLLQKVISNLSVWSSEQDLA NDTVQLLVTLVERRERANLVIQCENWWNLAKQFASRSPPLNFLSSPVQRT LMKALVLGGFAHMDTETKQQYWTEVLQPLQQRFLRVINQENFQQMCQQEE VKQEITATLEALCGIAEATQIDNVAILFNFLMDFLTNCIGLMEVYKNTPE TVNLIIEVFVEVAHKQICYLGESKAMNLYEACLTLLQVYSKNNLGRQRID VTAEEEQYQDLLLIMELLTNLLSKEFIDFSDTDEVFRGHEPGQAANRSVS AADVVLYGVNLILPLMSQDLLKFPTLCNQYYKLITFICEIFPEKIPQLPE DLFKSLMYSLELGMTSMSSEVCQLCLEALTPLAEQCAKAQETDSPLFLAT RHFLKLVFDMLVLQKHNTEMTTAAGEAFYTLVCLHQAEYSELVETLLSSQ QDPVIYQRLADAFNKLTASSTPPTLDRKQKMAFLKSLEEFMANVGGLLCV K Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Sekvenciranjem klonova dobijenih iz cDNK biblioteke hipokampusa frakcionirane veličine odraslih, Nagase et al. (2000) klonirali XPO4, koji su označili kao KIAA1721. 3' UTR sadrži ponavljajuću sekvencu, a protein od 1.150 aminokiselina dijeli 99% identiteta aminokiselina s mišjim Xpo4. RT-PCR ELISA testom otkrili su visoku do umjerenu ekspresiju u svim ljudskim tkivima i određenim regijama mozga.Nagase, T., Kikuno, R., Hattori, A., Kondo, Y., Okumura, K., Ohara, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 347-355, 2000. PubMed: 11214970
Korištenje afinitetne hromatografije na imobiliziranom RanGTP-u, za identifikaciju novih proteina koji vežu RanGTP u ekstraktu ćelije HeLa, nakon čega slijedi analiza baze podataka i 3' i 5' RACE, Lipowsky et al. (2000) klonirali mišji Xpo4, koji su nazvali Exp4. Izvedeni mišji protein od 1.170 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od 129,9 kD. Xpo4 ima sličnost u odnosu na motiv vezivanja za N-terminalni RanGTP sa članovima porodice importin-beta, sa najvećom sličnošću sa eksportinom-1 (XPO1) i eksportnim receptorom tRNK exportina-t (XPOT).
Funkcija gena Korištenjem rekombinantnog Xpo4 eksprimiranog u komponentama ćelije E. coli i ćelija HeLa, Lipowsky et al. (2000) pokazali su da je vezan za RanGTP Xpo4, odnosno EIF5A i timidilat sintazu (TYMS). Imunobloting test rekombinantnog EIF5A i vezanog Xpo4 pokazao je da EIF5A specifično formira kompleks EIF5A-Xpo4-RanGTP sa Xpo4 i da je interakcija Xpo4-EIF5A poboljšana u prisustvu RanGTP. Analize jedarnog ekspotra u permeabiliziranim ćelijama pokazale su da Xpo4 posreduje u specifičnom jedarnom eksportu EIF5A. Analizom mutacija i posttranslacijskih modifikacija, zaključili su da je interakcija Xpo4-EIF5A složena i zahtijeva velike dijelove molekula EIF5A i hipusinsku modifikaciju EIF5A.Kurisaki, A., Kurisaki, K., Kowanetz, M., Sugino, H., Yoneda, Y., Heldin, C.-H., Moustakas, A. The mechanism of nuclear export of Smad3 involves exportin 4 and Ran. Molec. Cell. Biol. 26: 1318-1332, 2006. PubMed: 16449645
Također pogledajte Hromosom 13 Ran (gen) SMAD3
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika