Protein 1 porodice TSC22 domena je protein koji je kod ljudi kodiran genom TSC22D1.
TSC22 kodira transkripcijski faktor i pripada velikoj porodici geni ranog odgovora. TSC22D1 kodira transkripcijski faktor i pripada velikoj porodici gena za rani odgovor. Putem fluorescentne ibridizacije in situ, Jay et al. (1996) locirali su gen TSC22D1 na hromosomu 13, sekvenca 13q14.Jay, P., Ji, J. W., Marsollier, C., Taviaux, S., Berge-Lefranc, J.-L., Berta, P. Cloning of the human homologue of the TGF-beta-stimulated clone 22 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 222: 821-826, 1996. PubMed: 8651929
TSC22D1 tvori homodimere, preko konzerviranog domena leucinskog zatvarača i heterodimerizuje s TSC22D4. TSC22D1 ima transkripcijsku represorsku aktivnost.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.073 aminokiseline, a molekulska težina 109.677 Da..
1020304050 MHQPPESTAAAAAAADISARKMAHPAMFPRRGSGSGSASALNAAGTGVGS NATSSEDFPPPSLLQPPPPAASSTSGPQPPPPQSLNLLSQAQLQAQPLAP GGTQMKKKSGFQITSVTPAQISASISSNNSIAEDTESYDDLDESHTEDLS SSEILDVSLSRATDLGEPERSSSEETLNNFQEAETPGAVSPNQPHLPQPH LPHLPQQNVVINGNAHPHHLHHHHQIHHGHHLQHGHHHPSHVAVASASIT GGPPSSPVSRKLSTTGSSDSITPVAPTSAVSSSGSPASVMTNMRAPSTTG GIGINSVTGTSTVNNVNITAVGSFNPNVTSSMLGNVNISTSNIPSAAGVS VGPGVTSGVNVNILSGMGNGTISSSAAVSSVPNAAAGMTGGSVSSQQQQP TVNTSRFRVVKLDSSSEPFKKGRWTCTEFYEKENAVPATEGVLINKVVET VKQNPIEVTSERESTSGSSVSSSVSTLSHYTESVGSGEMGAPTVVVQQQQ QQQQQQQQQPALQGVTLQQMDFGSTGPQSIPAVSIPQSISQSQISQVQLQ SQELSYQQKQGLQPVPLQATMSAATGIQPSPVNVVGVTSALGQQPSISSL AQPQLPYSQAAPPVQTPLPGAPPPQQLQYGQQQPMVSTQMAPGHVKSVTQ NPASEYVQQQPILQTAMSSGQPSSAGVGAGTTVIPVAQPQGIQLPVQPTA VPAQPAGASVQPVGQAPAAVSAVPTGSQIANIGQQANIPTAVQQPSTQVP PSVIQQGAPPSSQVVPPAQTGIIHQGVQTSAPSLPQQLVIASQSSLLTVP PQPQGVEPVAQGIVSQQLPAVSSLPSASSISVTSQVSSTGPSGMPSAPTN LVPPQNIAQTPATQNGNLVQSVSQPPLIATNTNLPLAQQIPLSSTQFSAQ SLAQAIGSQIEDARRAAEPSLVGLPQTISGDSGGMSAVSDGSSSSLAASA SLFPLKVLPLTTPLVDGEDESSSGASVVAIDNKIEQAMDLVKSHLMYAVR EEVEVLKEQIKELIEKNSQLEQENNLLKTLASPEQLAQFQAQLQTGSPPA TTQPQGTTQPPAQPASQGSGPTA Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Skriningom male količine klonova u biblioteci cDNK, od 6-sedmičnih mišjih embriona, Jay et al. (1996) klonirali su TSC22D1, koji su nazvali TSC22. Izvedeni protein sa 144 aminokiseline imao je izračunatu molekulsku masu od oko 16,7 kD i leucinski zatvarač, C-kraj bogat glutaminom i prolinom i dva potencijalna mjesta fosforilacije. TSC22 dijeli značajnu homolog[iju sa Tsc22 kod miševa, pacova i kokoši, a 69% identiteta sa svinjskim Dsipom i 52% identiteta sa proteinom za kratkovidnost kod Drosophila. Zoo blot analiza otkrila je srodne sekvence kod svih zastupljenih kičmenjaka i voćnih mušica. Signal nije otkriven u dagnjama, nematodama, kvascima i bakterijama.
Prema Southwestern scriningu, Ohta et al. (1996) identificirali su pacovaa Tsc22 vezanjem za G–C-bogati element promotora CNP. Koristili su ovu sekvencu za oblikovanje prajmera i kloniranja ljudskog TSC22, pomoću PCR-a i 3' i 5' RACE biblioteke cDNK fetusnog bubrega. Ljudski TSC22 razlikuje se od proteina pacova po inserciji jednog ostatka i jednoj zamjeni. Proteini pacova i miša su identični.
Prema Northern blot analizi, Jay et al (1996) i Ohta et al. (1996) utvrdili su da je TSC22 eksprimiran kao 1,8 kb transkript u različitim količinama u svim tkivima fetusa i odraslih, osim leukocita periferne krvi. Transkript od oko pet kb također je otkriven u skeletnim mišićima.Ohta, S., Shimekake, Y., Nagata, K. Molecular cloning and characterization of a transcription factor for the C-type natriuretic peptide gene promoter. Europ. J. Biochem. 242: 460-466, 1996. PubMed: 9022669
Funkcija gena Analizom pomaka mobilnosti i kotransfekcijom s reporter-plazmidom, Ohta et al. (1996) potvrdili su da se pacovski Tsc22 veže i može podstaknuti ekspresiju iz sekvence CNP promotora, bogate GC-om. U endotelnim ćelijama ljudske aorte ekspresiju TSC22 stimulirali su citokini, uključujući TGFB, i brzo se izgubila. Ekspresija TSC22 iRNK korelira sa povećanim nivoom CNP iRNK.
Analizom 2-hibrida kvasca, ispitivanjem pomaka gela i eksperimentima povlačenja GST-a, Kester et al. (1999) potvrdili su da TSC22D1 formira homodimere, preko konzerviranog domena leucinskog zatvarača i da stupa u interakciju s TSC22D4, formiranjem heterodimera. Pokazali su da TSC22D1 ima transkripcijsku represorsku aktivnost.Kester, H. A., Blanchetot, C., den Hertog, J., van der Saag, P. T., van der Burg, B. Transforming growth factor-beta-stimulated clone-22 is a member of a family of leucine zipper proteins that can homo- and heterodimerize and has transcriptional repressor activity. J. Biol. Chem. 274: 27439-27447, 1999. PubMed: 10488076 Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Transkripcijski faktori Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika