Ankirini (grč. ἄγκυρα, ἄγκυρα – ankyra = sidro) su porodica proteina koji posreduju u vezivanju integralnog membranskog proteina na spektrin-aktin segmentu, baziranom na membranskom citoskeletu. Ankirini imaju mjesta vezanja za beta podjedinicu spektrina i najmanje 12 porodica integralnih membranskih proteina. Ova veza je potrebna za održavanje integriteta plazmamembrana i za učvršćivanje specifičnih ionskih kanala, ionskih izmjenjivača i ionskih transportera u plazmamembrani.
Struktura Ankirini sadrže četiri funkcionalna domene: N-terminalna domena koja sadrži 24 tandemska ankirinska ponavljanja , centralni domeni koji se veže za spektar, domen smrti koji se veže na uključene proteine u apoptozi i regulatorni domen C-terminala koji je vrlo varijabilan među različitim ankirinskim proteinima.
Prepoznavanje membranskog proteina Za prepoznavanje širokog spektra membranskih proteina odgovorna su 24 tandemska ankirinska ponavljanja. Ova ponavljanja sadrže tri strukturno različita mjesta vezanja, u rasponu od ponavljanja 1-14. Ova mjesta vezivanja su međusobno gotovo neovisna i mogu se koristiti u kombinaciji. Interakcije koje mjesta koriste da se vežu za membranske proteine su nespecifične i sastoje se od: vodikove veze, hidrofobnih i elektrostatičkih interakcija. Ove nespecifične interakcije daju ankirinu svojstvo da prepozna veliki raspon proteina, jer sekvenca ne mora biti konzervirana, već samo sa svojstvima aminokiselina. Kvazi-nezavisnost znači da ako se mjesto vezivanja ne koristi, to neće imati veliki uticaj na cjelokupno vezivanje. Ova dva svojstva u kombinaciji daju veliki repertoar ankirinskih proteina koje mogu prepoznati.
Podtipovi Ankirini su kod sisara kodirani sa tri gena (ANK1, ANK2 i ANK3). Svaki gen zauzvrat proizvodi više proteina putem alternativne prerade.
ANK1 Gen ANK1 kodira protein ankirin R, koji je prvi put okarakteriziran u ljudskim eritrocitima, gdje je nazvan eritrocitni ankirin ili pruga 2.1. Ankirin R omogućava eritrocitima da se odupru silama smicanja koje se javljaju u cirkulaciji. Osobe sa smanjenim ili defektnim ankirinom R imaju oblik hemolitske anemije koji se naziva nasljedna sferocitoza. U eritrocitima, ankirin R veže membranski citoskelet za prugu 3Cl−/HCO3− anionskog izmjenjivača.
Ankirin 1 povezuje membranski receptor CD44 sa receptorom inozitol-trifosfata i citoskeletom.
Sugerirano je da ankirin 1 stupa u interakciju s KAHRP (prikazano putem selektivnih padajućih oblika, SPR i ELISA).
ANK2 thumb|280px|Lijevo: Palmitoilacija (crveno) ankirinskog sidra G na plazmamembrani. Desno: Izbliza, palmitoilni ostatak u žutoj boji Nakon toga, proteini ankirin B (proizvodi gena ANK2) ) identificirani su u mozgu i mišićima. Proteini ankirin B i ankirin G potrebni su za polariziranu distribuciju mnogih membranskih proteina, uključujući Na+/ K+ ATPazu, naponski Na+ kanal i Na+/Ca2+ izmjenjivač.
ANK3 Ankirin G proteini (proizvodi gena ANK3 ) identificirani su u epitelnim ćelijama i neuronima. Genetička analiza velikih razmjera, sprovedena 2008., pokazuje mogućnost da je ANK3 uključen u bipolarni poremećaj.
Također pogledajte DARPin
Reference
Vanjski linkovi
Ankyrin-R
Kategorija:Proteini periferne membrane Kategorija:Biologija bipolarnog poremećaja Kategorija:Biomolekule