Transpeptidaza sortiranja proteina je enzim, kao što je sortaza SrtA Staphylococcus aureus, za cijepanje jednog ili više ciljnih proteina koje proizvodi ista ćelija, kao dio specijaliziranog puta zvanog usmjeravanje proteina. Tipska prokariotska transpeptidaza za sortiranje proteina karakterizirana je kao proteaza, ali ne hidrolizira jednostavnu peptidnu vezu. Umjesto toga, veći, N-terminalni dio otcijepljenog polipeptida prenosi se na drugu molekulu, kao što je prekursor peptidoglikana ćelijskog zida u Gram-pozitivnim bakterijama.
Pojam sortaza ispravno je rezerviran za skup cistein proteaznih enzima sortaza A, sortaza B i članove dodatnih klasa, od kojih svi dijele homologiju. Međutim, sve veći broj dodatnih sistema za razvrstavanje proteina opisan je u prokariota, uključujući enzime za razvrstavanje kojima nedostaje ikakva homologija sa sortazom i za koje se čini da su nastali odvojeno konvergentnom evolucijom. Iako su sortaze najbolje opisani članovi transpeptidaza za razvrstavanje proteina, rade na analognim enzimima akumuliranja arheosortaza, rombosortaza i enzima PorU tipa IX sistema lučenja (T9SS).
Enzim za razvrstavanje Mehanizam Srodni signal sortiranja Sortaza A Cistein-proteaza LPXTG Sortaza B Cistein-proteaza NPQTN Arheosortaza A Cistein-proteaza PGF-CTERM Egzosortaza A Cistein-proteaza PEP-CTERM Rombosortaza Serin-proteaza GlyGly-CTERM PorU kao u Porphyromonas gingivalis Serinske-proteaze T9SS C-terminalni beta-sendvič domen
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Enzimi