SLX4 (znan i kao BTBD12 i FANCP) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 20. Uključen je u popravak DNK, gdje ima važnu ulogu u završnim koracima homologne rekombinacije. Mutacije u genu su povezane s bolešću zvanom Fanconijeva anemija.
Verzija SLX4 prisutna kod ljudi i drugih sisara djeluje kao neka skela na kojoj drugi proteini formiraju nekoliko različitih multiproteinskih kompleksa. SLX1-SLX4 kompleks djeluje kao resolvazna Hollidayeva spojnica. Kao takav, kompleks cijepa veze između dva homologna hromosoma koje nastaju tokom homologne rekombinacije. Ovo omogućava da se dva povezana hromosoma razdvoje u dvije nepovezane dvolančane molekule DNK. SLX4 interaktivni protein stupa u interakciju sa SLX4 u procesu popravka DNK, posebno u popravci međulančanih unakrsnih veza. SLX4 se takođe povezuje sa RAD1, RAD10 i SAW1 u jednostruki put homologne rekombinacije. Funkcija popravka DNK SLX4 uključena je u osjetljivost na zračenje protonskog snopa.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.834 aminokiseline, a molekulska težina 200.012 Da.
1020304050 MKLSVNEAQLGFYLGSLSHLSACPGIDPRSSEDQPESLKTGQMMDESDED FKELCASFFQRVKKHGIKEVSGERKTQKAASNGTQIRSKLKRTKQTATKT KTLQGPAEKKPPSGSQAPRTKKQRVTKWQASEPAHSVNGEGGVLASAPDP PVLRETAQNTQTGNQQEPSPNLSREKTRENVPNSDSQPPPSCLTTAVPSP SKPRTAQLVLQRMQQFKRADPERLRHASEECSLEAAREENVPKDPQEEMM AGNVYGLGPPAPESDAAVALTLQQEFARVGASAHDDSLEEKGLFFCQICQ KNLSAMNVTRREQHVNRCLDEAEKTLRPSVPQIPECPICGKPFLTLKSRT SHLKQCAVKMEVGPQLLLQAVRLQTAQPEGSSSPPMFSFSDHSRGLKRRG PTSKKEPRKRRKVDEAPSEDLLVAMALSRSEMEPGAAVPALRLESAFSER IRPEAENKSRKKKPPVSPPLLLVQDSETTGRQIEDRVALLLSEEVELSST PPLPASRILKEGWERAGQCPPPPERKQSFLWEGSALTGAWAMEDFYTARL VPPLVPQRPAQGLMQEPVPPLVPPEHSELSERRSPALHGTPTAGCGSRGP SPSASQREHQALQDLVDLAREGLSASPWPGSGGLAGSEGTAGLDVVPGGL PLTGFVVPSQDKHPDRGGRTLLSLGLLVADFGAMVNNPHLSDVQFQTDSG EVLYAHKFVLYARCPLLIQYVNNEGFSAVEDGVLTQRVLLGDVSTEAART FLHYLYTADTGLPPGLSSELSSLAHRFGVSELVHLCEQVPIATDSEGKPW EEKEAENCESRAENFQELLRSMWADEEEEAETLLKSKDHEEDQENVNEAE MEEIYEFAATQRKLLQEERAAGAGEDADWLEGGSPVSGQLLAGVQVQKQW DKVEEMEPLEPGRDEAATTWEKMGQCALPPPQGQHSGARGAEAPEQEAPE EALGHSSCSSPSRDCQAERKEGSLPHSDDAGDYEQLFSSTQGEISEPSQI TSEPEEQSGAVRERGLEVSHRLAPWQASPPHPCRFLLGPPQGGSPRGSHH TSGSSLSTPRSRGGTSQVGSPTLLSPAVPSKQKRDRSILTLSKEPGHQKG KERRSVLECRNKGVLMFPEKSPSIDLTQSNPDHSSSRSQKSSSKLNEEDE VILLLDSDEELELEQTKMKSISSDPLEEKKALEISPRSCELFSIIDVDAD QEPSQSPPRSEAVLQQEDEGALPENRGSLGRRGAPWLFCDRESSPSEAST TDTSWLVPATPLASRSRDCSSQTQISSLRSGLAVQAVTQHTPRASVGNRE GNEVAQKFSVIRPQTPPPQTPSSCLTPVSPGTSDGRRQGHRSPSRPHPGG HPHSSPLAPHPISGDRAHFSRRFLKHSPPGPSFLNQTPAGEVVEVGDSDD EQEVASHQANRSPPLDSDPPIPIDDCCWHMEPLSPIPIDHWNLERTGPLS TSSPSRRMNEAADSRDCRSPGLLDTTPIRGSCTTQRKLQEKSSGAGSLGN SRPSFLNSALWDVWDGEEQRPPETPPPAQMPSAGGAQKPEGLETPKGANR KKNLPPKVPITPMPQYSIMETPVLKKELDRFGVRPLPKRQMVLKLKEIFQ YTHQTLDSDSEDESQSSQPLLQAPHCQTLASQTYKPSRAGVHAQQEATTG PGAHRPKGPAKTKGPRHQRKHHESITPPSRSPTKEAPPGLNDDAQIPASQ ESVATSVDGSDSSLSSQSSSSCEFGAAFESAGEEEGEGEVSASQAAVQAA DTDEALRCYIRSKPALYQKVLLYQPFELRELQAELRQNGLRVSSRRLLDF LDTHCITFTTAATRREKLQGRRRQPRGKKKVERN
Modelni organizmi Modelni organizmi su bili istaknuti u proučavanju funkcije SLX4. Identifikovan je 2001. tokom skrininga na smrtonosne mutacije u ćelijama Saccharomyces cerevisiae kojima nedostaje funkcionalna kopija proteina Sgs1. Na osnovu toga, SLX4 je grupiran sa nekoliko drugih proteina proizvedenih od SLX (sintetski letalni gen nepoznate funkcije).
+Fenotip Slx4 nokaut-miševa Svojstvo Fenotip Vijabilnost homozigotaNenormalan Plodnost Nenormalan Body weight NeNormalan Anksioznost otvorenog polja Normalan Neurološka procjena Normalan Snaka stiska Normalan Test vruće ploče Normalan Dismorfologija Nenormalan Indirektna kalorimetrija Normalan Test tolerancije glukoze Normalan Auditivni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Nenormalan Radiografija Nenormalan Tjelesna temperatura Normalan Morfologija okaNenormalan Klinička hemija Normalan Hematologija Nenormalan Limfociti periferne krviNormalan Mikronukleus test Nenormalan Težina srcaNenormalan Histopatologija kože Normalan Histopatologija mozga Normalan Salmonella infekcija Normalan Citrobacter infekcija Normalan Svi testovi i analize urađenu su prtema izvoru:Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. Uslovna linija nokaut-miševa, zvana Slx4tm1a(EUCOMM)Wtsi je generiran kao dio programa Međunarosnog konzorcija za nokaut-miševe, projekta mutageneze visoke propusnosti za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
Mužjaci i ženke su podvrgnute standardiziranom fenotipskom pregledu kako bi se utvrdili efekti delecija. Dvadeset četiri testa obavljena su na mutantnim miševima i uočeno je deset značajnih abnormalnosti. Studija održivosti pri odbijanju je pokazala da je prisutno manje homozigotnih mutantnih životinja nego što je predviđeno Mendelovim omjerom. Homozigotne mutantne životinje oba spola bile su subfertilne, a homozigotne ženke su imale smanjenu tjelesnu težinu i dužinu, težinu srca, broj trombocita i masnu masu. Homozigoti oba spola su imali abnormalne veličine očiju, uske otvore za oči, defekte skeleta (uključujući skoliozu i fuziju pršljenova) i pokazali su povećanje nestabilnosti DNK što je pokazao mikronukleus test. Ova i daljnja analiza otkrila je fenotip miša za modeliranje ljudske genetičke bolesti, Fanconijeva anemija. Povezanost je potvrđena kada je otkriveno da pacijenti s bolešću imaju mutacije u svom genu SLX4.
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Popravak DNK Kategorija:Mišji mutirani geni Kategorija:Geni na hromosomu 20 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika