Come in ogni episodio della saga di Zelda, l'interazione con i personaggi non giocanti è una caratteristica fondamentale del gioco.
Quello che segue è l'elenco dei personaggi principali di Majora's Mask.
??? (mano) È una mano che alla mezzanotte di qualsiasi giorno, esce dal gabinetto dello Stock Pot Inn e chiede della carta a Link. In cambio gli dà un pezzo di cuore. È presente anche in Oracle of Ages e Skyward Sword
"Alieni" Sono dei fantasmi che (ogni anno in cui c'è il Carnival of Time) fanno irruzione nel Romani Ranch dalle 2:30 a.m. del primo giorno fino alle 5:15 dello stesso giorno; vengono con una palla di luce e cercano di arrivare al granaio per rubare le mucche (per un motivo ignoto). Se Link riesce a difendere le mucche riceverà una bottiglia di latte. Se non ci riesce, Romani (la sorellina minore di Cremia) verrà rapita insieme alle mucche e riportata al terzo giorno con la memoria cancellata. Se si rallenta il tempo, l'attacco sarà più lento, ma durerà di più.
Anju È la ragazza che gestisce, insieme alla madre, lo Stock Pot Inn. È molto smemorata e terribile come cuoca; si scusa sempre con tutti. È la fidanzata di Kafei, e attende impaziente il suo ritorno (dato che lui si nasconde e perché le ha promesso di andare da lei al termine del terzo giorno, per sposarla). Passa tutta la durata del primo giorno alla reception, preparando anche il pranzo per sua nonna (che però si rifiuta ostinatamente di mangiare, perché detesta il modo in cui la nipote cucina). Se nel pomeriggio dello stesso giorno, se le si parla con la maschera di Kafei, lei darà a Link un appuntamento notturno nella cucina. Durante l'appuntamento Link le promette di ritrovare Kafei e ottiene una lettera per quest'ultimo. Anche nel secondo giorno (solo se è in corso la missione secondaria tra Kafei e Anju) lei si troverà alla reception. Se no, alla reception sarà presente la madre e di conseguenza la ragazza andrà al Laundry Pool a cercare Kafei, ma egli non comparirà. Durante la notte di questo giorno Anju ha una discussione con la madre perché quest'ultima sostiene che Kafei l'abbia abbandonata e che sia fuggito con Cremia, un'amica di Anju. Nel terzo giorno fa le pulizie nella camera degli artisti di Gorman. Nella notte o rimarrà nella sua camera ad attendere Kafei oppure fuggirà al Romani Ranch con la madre e la nonna. Questo personaggio lo ritroviamo in Ocarina of Time e in The Minish Cap, come allevatrice di polli che chiede a Link di riprenderle i polli che le sono fuggiti (in Ocarina of Time è allergica ai polli, in Minish Cap no).
Nonna di Anju È la nonna di Anju. È una signora molto anziana e piuttosto rimbambita e ama raccontare le storie, e scambia sempre Link per Tortus, il padre di Anju nonché suo figlio. Racconta due storie ma son troppo lunghe e Link si addormenta ascoltandole. Se Link riesce a restare sveglio per tutta la durata delle storie (usando la All-night Mask) avrà un pezzo di cuore. Nel diario della nonna si legge che la loro famiglia si trasferirà il terzo giorno al Romani Ranch per rifugiarsi dalla Luna (Anju e Cremia sono amiche). Si può anche assistere ad un dialogo tra Anju e sua nonna, che fa di tutto per non mangiare il cibo preparato dalla nipote. Questa donna sembra aver lavorato come insegnante nella città di Clock Town, e a volte nomina il nome "Gampy", che si presume essere il nome della madre di Anju oppure, molto probabilmente, si riferisce al suo defunto marito. Non a caso la vecchia nonna viene chiamata Granny (che è una storpiatura del nome Grandma=Grandmother=Nonna), e si pensa dunque che "Gampy" stia per Grandpa, ovvero nonno. Questo personaggio c'è anche in Ocarina of Time, dove è la vecchia strega nel villaggio di Kakariko, che si vede solo quando Link è adulto, capace di creare la pozione blu.
Madre di Anju È la madre di Anju. È una signora con i capelli raccolti e la si può vedere qualche volta alla reception. Se le si parla con la maschera di Kafei, si arrabbia molto (perché Kafei è sparito e perché sostiene che tra lui e Cremia ci sia un flirt.) Questa ipotesi viene confermata dalla conversazione tra lei e la figlia Anju, che avviene alle 9:30 p.m. del secondo giorno, e che Link può origliare entrando dalla "sua" camera (può farlo solo se è in possesso della chiave che riceve parlando ad Anju il primo giorno, prima delle 4 del pomeriggio), mettendosi davanti allo squarcio che c'è nel muro. Si sente infatti una discussione tra madre e figlia, dove la prima sostiene che Kafei sia scappato con Cremia e che l'abbia abbandonata, proprio come suo marito ha fatto con lei. Nella notte del terzo giorno, (se si è iniziato il quest'tra Kafei e Anju), sta nella casa di Romani a incolparsi di aver educato in tal modo la figlia (Anju infatti rimarrà nella sua camera ad attendere Kafei). Nel diario della nonna si legge il nome Gampy, nome che potrebbe essere quello della madre di Anju.
Shikashi È un uomo che gestisce l'osservatorio astronomico di Clock Town e consente ai Bombers di utilizzare il laboratorio come nascondiglio segreto. Passa le giornate a passeggiare avanti e indietro con le mani dietro la schiena. Il personaggio è presente anche in Ocarina of Time
Aveil Aveil è il capo dei pirati presenti sulla Great Bay Coast. Link non la incontra mai, la vede soltanto mentre la spia dall'alto da una finestra, mentre sta sgridando una ragazza della ciurma, perché vuole impossessarsi delle uova di Lulù e i pirati non sono ancora riusciti a rubarle agli Zora. Questo personaggio c'è anche in Ocarina of Time, dove è la guardia delle prigioni dove sono rinchiusi i carpentieri.
Banchiere È un ragazzo (non si capisce se maschio o femmina) che gestisce la banca di Clock Town; per riconoscere i clienti, segna il loro nome con uno speciale inchiostro, il che permette a Link di usare la banca anche quando è trasformato. Si muove sempre, anche se è inginocchiato. Se il numero delle Rupie che Link vi deposita (non è obbligatorio farlo) arriva a 5000, otterrà un pezzo di cuore. Questo personaggio lo troviamo anche in Ocarina of Time, nell'Hyrule Castle Town (quando Link è bambino) e al Kakariko Village (quando Link è adulto) e anche lì è sempre inginocchiato e dona delle rupie per ogni scarafaggio o pesce che Link gli porta.
I Fratelli Castoro Sono due castori che abitano sulla Grande Baia, dietro una cascata. Collezionano bottiglie, e ne daranno una a Link se li batterà nella corsa (a nuoto) tra le loro dighe.
Grande Goron Questo enorme Goron si trova sul Tempio di Testanevosa. Passa il tempo a soffiare, per via di una maledizione lanciatagli da Skull Kid, che lo costringe a soffiare e lo rende invisibile, provocando un fortissimo vento. Se Link gli suona la Ninna nanna Goron, il Grande Goron si addormenterà, cadendo quindi nel crepaccio. Nella primavera che viene sconfiggendo Goth, lui sta seduto in una pietra a Testanevosa, affermando di non ricordarsi nulla. È presente anche in Ocarina of Time
Proprietario del Negozio di Bombe È un ragazzo calvo che gestisce un negozio di bombe nella zona ovest di Clock Town. È il figlio della vecchietta che viene attaccata dal ladro Sakon nella mezzanotte del primo giorno. Il personaggio è presente anche nell'Hyrule Castle Town di Ocarina of Time e anche lì gestisce un negozio di bombe.
I Bomber È una società formata da sei bambini un po' birichini, di cui cinque sono sempre in giro e uno fa la guardia all'ingresso dell'Osservatorio Astronomico. Il loro scopo è quello di aiutare i cittadini. Il loro capo (quello col cappello rosso) si chiama Jim. Se Link (ancora sotto forma di Deku Scrub) riuscirà a entrare nel gruppo (Jim gli proporrà un gioco: deve ritrovare tutti e cinque i Bombers che sono nascosti nella città, prima dell'alba del giorno successivo) riceverà un codice che dovrà dare al sesto Bombers per andare all'Osservatorio Astronomico. Se riuscirà a entrare nel clan anche in forma umana, riceverà il Bomber's Notebook, un taccuino dove vengono segnate le persone e i favori che gli si promette. Jim, come tutti gli altri 5 bambini, è molto simile al bambino di Ocarina of Time che giocava nel cimitero di Kakariko Village.
Cremia È la ragazza che si occupa della Fattoria Romani (cedutale dal padre, ora anziano), famoso per il suo latte squisito (venduto al Bar Latteo). Vive con la sorellina Romani, che parla sempre di strani "alieni", ma la ragazza non crede alle parole della piccola. Ultimamente ha dei problemi nel consegnare il latte, perché viene sempre attaccata da due delinquenti (che non sono altro che i fratelli Gorman mascherati da ninja). Se Link la aiuta a difendere il latte, gli darà la Maschera Romani (in seguito darà 200 rupie o un abbraccio). Si dice che Cremia sia innamorata di Kafei, il futuro marito della sua amica Anju, e per questo motivo né lei e né Kafei piacciono alla madre di Anju. Nonostante il fidanzamento dei due, Cremia è molto felice per loro, e non ha mai fatto nulla per ostacolarli. Il personaggio è la versione adulta di Malon in Ocarina of Time
Dampei È il becchino del cimitero d'Ikana. Passa le giornate a passeggiare nel cimitero, con un badile sulla spalla. Nella sua versione di Termina, rispetto alla versione di Hyrule, ha paura dei fantasmi: infatti, parlandogli col "Captain's Hat", una maschera, scapperà terrorizzato e si chiuderà in casa. È apparso anche in Ocarina of Time sempre con lo stesso nome e ruolo, ma si era anche appresa la sua morte. In questo gioco è curiosamente ritornato in vita
Darmani III Darmani è l'eroe dei Goron. Quando il lungo inverno è sceso sulla montagna, è partito verso il Tempio di Testanevosa per capirne le cause, ma è stato scaraventato in un dirupo da un vento formidabile (ovvero il soffio di Grande Goron), ed è morto. Dopo che Link gli suona la Melodia del Ristoro, riceverà la Maschera Goron, che lo trasformerà in Darmani. Ha un rapporto molto stretto con l'Anziano Goron (si dice che siano padre e figlio) e con suo figlio (che considera Darunia il suo mito, e che stando a quanto detto prima dovrebbe essere il fratellino di Darmani). In questa forma, Link potrà competere con i Goron e partecipare anche alle loro tradizioni (come la Goron' Racetrack) e potrà anche rotolare a velocità folle e sbloccare nuovi passaggi. Il personaggio è Darunia, il re dei Goron, di Ocarina of Time
Maggiordomo Deku È il maggiordomo del Re Deku. Quando Link riporta la Principessa Deku dal Re, il maggiordomo lo sfiderà a una corsa (molto simile a quella di Dampè in Ocarina of Time); se Link vince, avrà la Mask of Scent. Suo figlio è stato esiliato nel Lost Wood da Skull Kid quando, maledicendo Link e trasformandolo in un Deku Scrub, ha fuso la sua anima con quella di Link, trasformandolo in una strana pianta, che Link può incontrare all'inizio del gioco. Ogni volta che incontra Link, il maggiordomo si inchina sempre.
Re Deku Il Re dei Deku è molto impulsivo, e non esita a infliggere torture a una povera scimmietta, accusata di avere rapito la Principessa Deku, anche se non ci sono prove della sua colpevolezza.
Principessa Deku Figlia del Re Deku, viene rapita da Odolwa. Quando Link la trova, la riporta al palazzo dentro una bottiglia. Appena la Principessa vede la scimmia torturata, picchia il padre e gli ordina di liberarla.
Epona
È la cavalla di Link (in realtà apparteneva a Malon di Ocarina Of Time, che l'ha regalata a Link perché lui l'ha salvata); ha il manto marrone e una criniera chiara. Viene catturata dallo Skull Kid all'inizio del gioco, per poi ricomparire misteriosamente nel Romani Ranch. Link può montare Epona solo nella sua forma umana. Per chiamarla, Link deve suonare la Canzone di Epona, ed Epona comparirà immediatamente, preceduta da un nitrito. Il nome di Epona deriva da una figura mitologica di origine gallica dal nome celtico di Epona. La cavalla appare anche in Ocarina of Time (solo Link adulto la può cavalcare) e in Twilight Princess.
Evan