La stagione 1998-99 dei Toronto Raptors fu la 4ª nella NBA per la franchigia.
I Toronto Raptors arrivarono sesti nella Central Division della Eastern Conference con un record di 23-27, non qualificandosi per i play-off.
Roster
Staff tecnico Allenatore: Butch Carter Vice-allenatori: Jim Thomas, Joe Harrington, Brian James
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