La stagione 2008-09 dei Rio Grande Valley Vipers fu la 2ª nella NBA D-League per la franchigia.
I Rio Grande Valley Vipers arrivarono quarti nella Southwest Division con un record di 21-29, non qualificandosi per i play-off.
Roster
Staff tecnico Allenatore: Clay Moser Vice-allenatore: Robert Pack Preparatore atletico: Joe Resendez
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