L'E3 Prijs Vlaanderen 2004, quarantasettesima edizione della corsa, valido come evento del circuito UCI categoria 1.1, fu disputato il 27 marzo 2004 per un percorso di 195 km. Fu vinto dal belga Tom Boonen, al traguardo in 4h31'00" alla media di 43,173 km/h.
Dei 175 ciclisti alla partenza furono in 78 a portare a termine il percorso.
Ordine d'arrivo (Top 10) CorridoreSquadraTempo1 Tom BoonenQuick Step4h31'00"2 Jaan KirsipuuAG2Rs.t.3 Andris NaudužsDomina Vac.s.t.4 Steven De JonghRabobanks.t.5 Marcus LjungqvistAlessios.t.6 Gabriele BalducciSaecos.t.7 Andreas KlierT-Mobiles.t.8 Roger HammondMr Bookmakers.t.9 Léon van BonLottos.t.10 Fabio BaldatoAlessios.t.
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2004 Categoria:Ciclismo nel 2004