Хаплогрупата D-M55 (M64.1/Page44.1) позната и како Хаплогрупа D1a2a — хаплогрупа со Y хромозом. Таа е една од двете гранки на Хаплогрупата D1a. Другата е D1a1, која се среќава со висока честота кај Тибеќаните и другите тибето-бурмански населенија и географски блиски групи. D е исто така распространета со мала до средна честота во Средна Азија, Источна Азија и континентална Југоисточна Азија.

Хаплогрупата D-M55 се наоѓа кај околу 33% YOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males. од денешните јапонски мажи. Била пронајдена во четиринаесет од примерокот од шеснаесет или 87,5% од примерокот кај мажите Ајни во едно иследување објавено во 2004 година и во три од примерок од четири или 75% од примерокот кај мажите Ајни во друго проучување објавено во 2005 година во која некои поединци од студијата од 2004 година можеби биле повторно тестирани. Во моментов таа е најчестата Y-ДНК хаплогрупа во Јапонија доколку O1-F265 и O2-M122 (Најновиот заеднички предок (НЗП) приближно 30.000 ~ 35.000 п.с.) се сметаат за посебни хаплогрупи. Хаплогрупата D-M55 можеби е родена во Јапонија во секое време помеѓу нејзината НЗП со D-Y34637 (најдена во денешни Онги и Јарави) пред околу 45.000 години и НЗП на сите постоечки гранки на D-M55 пред околу 21.000 години.

Во 2017 година било потврдено дека јапонската гранка на хаплогрупата D-M55 е различна и изолирана од другите гранки на хаплогрупата D од пред околу 50.000 години. Расцепот во Д1а можеби се случил во близина на Тибетската Висорамнина.Mondal, Mayukh & Bergström, Anders & Xue, Yali & Calafell, Francesc & Laayouni, Hafid & Casals, Ferran & Majumder, Partha & Tyler-Smith, Chris & Bertranpetit, Jaume.

Историја десно|мини|300x300пкс| Патека на преселба на хаплогрупата Д мини|300x300пкс| Миграциски пат на хаплогрупите Y-ДНК во Источна Азија Меѓу подгрупите на Хаплогрупата D, предокот на D-М55 отишол на исток за да стигне до јапонскиот архипелаг.崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版　2009年）(in Japanese) Според Мајкл Ф. Хамер од Универзитетот во Аризона, хаплогрупата D настанала во близина на Тибетската Висорамнина и мигрирала во Јапонија кога на крајот станала D-M55. Мицуру Сакитани рекол дека Хаплогрупата D1 дошла од Тибет до северниот дел на Кјушу преку Алтајските Планини и Корејскиот Полуостров, а Хаплогрупата D-М55 (D1а2а) била родена во јапонскиот архипелаг.

Неодамнешните проучувања сугерираат дека D-M55 станала доминантен за време на доцниот период на Џомоните, непосредно пред доаѓањето на Јајоите, што укажува на популационен бум и пад.

Честота Просечната честота на Јапонци е околу 33%. Високите честоти се наоѓаат на различни места во Јапонија, особено во Хокаидо, источен Хоншу, јужен Кјушу и Окинава.

Ајни: 87,5% (Таџима и сор. 2004) Асахикава (Хокаидо): 63,7% (проценето од хаплотиповите Y-STR) Чиба: 45,5% Токио: 40,4% (21/57 = 36,8% JPT, 23/52 = 44,2% ) Окинава: 37,6% (0/7 Хатерума, 1/20 = 5,0% Ириомоте, 8/29 = 27,6% Кацурен, 10/32 = 31,3% Јомитан, 16/49 = 32,7% Ишигаки, 13/38 = 34,2% Мијако, 13/36 = 36,1% Хебару, 7/19 = 36,8% Гушиками, 35/87 = 40,2% Окинава проценета од Y -STR хаплотипови, 38/80 = 47,5% Итомане, 25/45 = 55,6% Окинава) Регион Канто : 37,6% Кјушу: 35,0% (8/31 = 25,8% префектура Фукуока,Hirofumi Nohara, Ikuko Maeda, Rinnosuke Hisazumi, Taketo Uchiyama, Hiroko Hirashima, Masahito Nakata, Rika Ohno, Tetsuro Hasegawa, and Kenshi Shimizu (2021), "Geographic distribution of Y-STR haplotypes and Y-haplogroups among Miyazaki Prefecture residents." Japanese Journal of Forensic Science and Technology, Vol. 29/104 = 27,9% Кјушу, 90/300 = 30,0% студенти на колеџот Нагасаки, 39/129 = 30,2% Префектура Чикана Средношколци, 34/102 = 33,3% возрасни мажи од Фукуока, 7/21 = 33,3% Префектура Нагасаки, 13/37 = 35,1% Префектура Оита, 95/270 = 352. % Префектура Мијазаки,Y Seo, Y Takami, T Nakayama, and K Takahama, "Y chromosome DNA polymorphisms and their haplotypes in a Japanese population." Leg Med (Tokyo) 1999 Sep;1(3):145-9. 470/1285 = 36,6% Префектура Мијазаки, 58/151 = 38,4% Префектура Кагошима, 5/11 = 45,5% Префектура Сага, 22/48% Кумамото) Нагоја: 34,3% (проценето од хаплотиповите Y-STR) Сапоро: 33,9% (100/302 = 33,1% студенти од колеџот Сапоро, 72/206 = 35,0% возрасни мажи Сапоро) Кавасаки: 33,0% Шизуока: 32,8% Каназава: 32,6% (97/298 = 32,6%, 76/232 = 32,8%) Аомори: 31,1% (22/79 = 27,8%, 11/27 = 40,7%) Шикоку: 30% (18/70 = 25,7% Токушима, 9/31 = 29,0% Шикоку, 119/388 = 30,7% студенти од колеџот во Токушима） Микронезија: 1/17 = 5,9% (Хамер и сор. 2006) Јужна Кореја: 3/75 = 4,0% (Хамер и сор.), 12/317 = 3,8% (проценето од Y-STR хаплотипови), 8/506 = 1,6% (Ким и сор.2011 г. ) Западен Тимор : 1/497 = 0,2% (Тумонггор и сор. 2014 )

Древна ДНК Човек од народот Џомон бил ископан од остатоците од Фунадомари (околу 3.800 - 3.500 п.с.) на островот Ребун во Хокаидо. Тој припаѓа на хаплогрупата D1a2a2a (D-CTS220).神澤ほか(2016)「礼文島船泊縄文人の核ゲノム解析」第70回日本人類学大会 (in Japanese)

Анализата на примерокот Џомон (Икавазу) и древен примерок од Тибетската Висорамнина (Чохопани, Ch) открила само делумно заедничко потекло, што укажува на позитивно генетско тесно грло во врска со ширењето на хаплогрупата од древно население поврзано со примерокот од тибетските Чокопани (и современи тибето-бурмански групи).

Филогенетско дрво Со дрво ISOGG (Верзија: 14.151).

DE (YAP) D (CTS3946) D1 (M174/Page30, IMS-JST021355, Хаплогрупа D-M174) D1a (CTS11577) D1a1 (F6251/Z27276) D1a1a (M15) Тибет D1a1b (P99) Тибет, Монголци, Средна Азија D1a2 (Z3660) D1a2a (M64.1/Page44.1, M55) Јапонија (Јамато, народ Рјукјуан, народ Ајни ) D1a2b (Y34637) Андамански Острови ( Онги, Јарави) D1b (L1378) Филипини Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014 D2 (A5580.2) Нигерија, Афроамериканци, Саудиска Арабија, Сирија

Наводи

D-M55