Лигаза ― ензим кој катализира спојување (лигација) на две молекули со формирање нова хемиска врска. Ова се случува преку хидролиза на хемиска група на една од молекулите, што резултира со формирање на нови CO, CS или CN врски. На пример, ДНК лигазата може да спои два комплементарни фрагменти од нуклеинска киселина со формирање фосфодиестерски врски и да поправи едноверижни прекини што се јавуваат во двоверижна ДНК за време на репликацијата.
Општо земено, лигазата ја катализира следната реакција на дехидратација, со што ги спојува молекулите А и Б:
A-OH + BH → A–B + H2O
Номенклатура Именувањето на лигазите е неконзистентно и затоа овие ензими се познати под неколку различни имиња. Општо земено, вообичаените имиња на лигазите го вклучуваат зборот „лигаза“, како на пример ДНК лигаза, ензим кој најчесто се користи во лабораториите за молекуларна биологија за спојување на ДНК фрагменти. Сепак, многу ензими го користат терминот „синтетаза“ или „синтаза“, бидејќи се користат за синтетизирање на нови молекули. Исто така, постојат некои лигази кои го користат името „карбоксилаза“ за да означат дека ензимот специфично катализира реакција на карбоксилација.
Забелешка: биохемиската номенклатура понекогаш ги разликува синтетазите од синтазите, а понекогаш ги третира зборовите како синоними. Вообичаено, двата термина се користат наизменично и двата се користат за опишување на лигазите.
Класификација Лигазите се класифицирани како EC 6 во EC класификацијата на ензими. Лигазите можат понатаму да се класифицираат во шест подкласи:
EC 6.1 вклучува лигази што се користат за формирање врски јаглерод-кислород EC 6.2 вклучува лигази што се користат за формирање врски јаглерод-сулфур EC 6.3 вклучува лигази што се користат за формирање врски јаглерод-азот (вклучувајќи аргининосукцинат синтетаза ) EC 6.4 вклучува лигази што се користат за формирање врски јаглерод-јаглерод, како што е ацетил-CoA карбоксилазата EC 6.5 вклучува лигази што се користат за формирање фосфорни естерски врски, како што е ДНК лигазата EC 6.6 вклучува лигази што се користат за формирање азотно-метални врски, како кај хелатите.
Мембрански асоцирани лигази Некои лигази се поврзуваат со биолошките мембрани како периферни мембрански протеини или се закотвени преку една трансмембранска спирала,Superfamilies of single-pass transmembrane ligases in Membranome database на пример одредени протеини поврзани со убиквитин лигазата.
Наводи
Надворешни врски EC 6 Вовед од Одделот за хемија на Квин Мери, Универзитет во Лондон
Категорија:Ензими