Дельта-варіант SARS-CoV-2, також відомий як лінія поколінь B.1.617.2 — варіант лінії поколінь B.1.617 SARS-CoV-2, вірусу, що спричинює коронавірусну хворобу 2019. Вперше його було виявлено в Індії наприкінці 2020 року. Всесвітня організація охорони здоров'я (ВООЗ) назвала його Дельта-варіантом 31 травня 2021 року.

Він має мутації в гені, що кодує спайковий білок SARS-CoV-2, викликаючи заміни T478K, P681R та L452R, які, як відомо, впливають на передачу вірусу, а також на те, чи можна його нейтралізувати антитілами для раніше циркулюючих варіантів вірусу SARS-CoV-2. у травні 2021 року спостерігала, що вторинна частота захворювання на 51–67 % перевищує альфа-варіант.

7 травня 2021 року Агенція охорони громадського здоров'я Англії змінили свою класифікацію за лінією поколінь B.1.617.2 з варіанту, що досліджується (VUI), на варіант, що викликає занепокоєння (VOC), на підставі оцінки передачі, що є принаймні еквівалентною B.1.1.7 (альфа-варіант), вперше виявлений у Великій Британії (як варіант Кента). Згодом 11 травня 2021 року ВООЗ також класифікувала цю лінію поколінь, як варіант, що викликає занепокоєння і сказала, що він демонструє вищу передачу та зменшену нейтралізацію. Вважається, що цей варіант частково відповідальний за другу хвилю пандемії в Індії, що почалася в лютому 2021 року.WHO labels a Covid strain in India as a 'variant of concern' — here's what we know , CNBC, 11 травня 2021. «WHO says India Covid variant of „global concern“» , BBC News, 11 травня 2021. «India's second COVID-19 wave» , The Wire Science, 22 квітня 2021. Пізніше це сприяло третій хвилі пандемії у Сполученому Королівстві, і ВООЗ попередила в липні 2021 року, що це може мати подібний ефект в інших країнах Європи.

18 червня 2021 року Агенція охорони громадського здоров'я Англії опублікувала технічний брифінг 16 щодо варіантів SARS-CoV-2, в якому зафіксували 73 випадки смерті серед 60 655 випадків інфікування дельта-варіантом SARS-CoV-2 у Великій Британії з летальністю лише 0,1 %. Це порівняно з летальністю у 1,9 % (приблизно в 19 разів вище, 4259 смертей у 224021 випадків), пов'язаною з альфа-варіантом.

Класифікація Дельта-варіант має мутації гена, що кодує білок шиповидних відростків вірусу SARS-CoV-2, що спричинює заміни E484Q та L452R. Він ідентифікований як клада 21А за системою філогенетичної класифікації .

Наприкінці травня 2021 року ВООЗ присвоїла назву Дельта лінії поколінь B.1.617.2 після введення нової політики використання грецьких літер для варіантів, що викликають занепокоєння, та варіантів, що цікавлять.

Інші підлінії поколінь B.1.617 На сьогодні класифіковано три підлінії поколінь B.1.617.

B.1.617.1 (VUI-21APR-01) був визначений варіантом, що досліджується у квітні 2021 року . Пізніше, у квітні 2021 року, два інші варіанти B.1.617.2 (VUI-21APR-02) та B.1.617.3 (VUI-21APR-03) були визначені як варіанти, що досліджуються. Хоча B.1.617.3 поділяє мутації L452R та E484Q, виявлені у B.1.617.1, B.1.617.2 не має мутації E484Q. B.1.617.2 має мутацію T478K, не знайдену в B.1.617.1 та B.1.617.3. Одночасно Європейський центр з профілактики та контролю захворюваності опублікував короткий звіт, у якому підтримує всі три підлінії поколінь B.1.617 як варіанти, що досліджуються, оцінюючи, що «необхідне більш глибоке розуміння ризиків, пов'язаних з цими лініями поколінь B.1.617, перш ніж можна буде розглядати будь-які зміни поточних заходів».

Мутації

+ Ген Нуклеотиди Амінокислоти ORF1b P314L P1000L Білок шиповидних відростків вірусу G142D T19R R158G L452R T478K D614G P681R D950N E156del F157del M I82T N D63G R203M D377Y orf3a S26L orf7a V82A T120I Джерела: CDC Covariants.org Дельта-геном B.1.617.2 має 13 мутацій (15 або 17 за деякими джерелами, залежно від того, чи включені більш загальні мутації), які спричиняють зміни в амінокислотних послідовностях білків, які він кодує. Чотири з них, усі з яких містяться у коді білка шиповидних відростків вірусу, викликають особливе занепокоєння: D614G. Заміна в позиції 614, аспарагінової кислоти на гліцин, поділяється на інші високотрансмісивні варіанти, такі як альфа, бета та гамма. T478K. Обмін в позиції 478 являє собою заміщення треоніну на лізин. L452R. Заміна в позиції 452, заміна лейцину на аргінін, надає сильнішу спорідненість спайкового білка до рецептора АСЕ2 і знижує здатність розпізнавання імунної системи. Ці мутації, взяті окремо, не є унікальними для варіанта; швидше, їх одночасне виникнення є унікальним. P681R. Заміна в позиції 681, заміна проліну на аргінін, яка, на думку , може підвищити рівень зараженості клітин цим варіантом «сприяючи розщепленню білка-попередника S до активної конфігурації S1/S2».

Мутація E484Q відсутня в геномі B.1.617.2.

Варіант «Дельта плюс»

Дельта-варіант з K417N відповідає лініям поколінь AY.1 та AY.2 і отримала назву «Дельта плюс» або «варіант Непалу». Він має мутацію K417N, яка також присутня у бета-варіанті. Обмін в позиції 417 є заміщенням лізину на аспарагін.

Симптоми Клінічний перебіг коронавірусної хвороби 2019 з появою і поширенням дельта-варіату певною мірою змінився порівняно з перебігом її до літа 2021 року. Хвороба перебігає швидше, часто із стрімким розвитком пневмонії. Заражені люди можуть помилково сприйняти прояви за сильну застуду і не усвідомлювати, що вони потребують ізоляції. Поширеними симптомами є головний біль, біль у горлі, нежить із ринореєю і гарячка. У Великій Британії, де варіант дельта становить 91 відсоток нових випадків, одне дослідження показало, що найчастими симптомами були головний біль, біль у горлі та нежить.

Лікування

Лікування інфікованих дельта-варіантом SARS-CoV-2 аналогічне, лікуванню хворих коронавірусною хворобою 2019.

Ефективність вакцини

виявила, що сироватки-реконвалесценти хворих на COVID-19 та реципієнтів вакцини BBV152 (Covaxin) компанії змогли нейтралізувати варіант, що досліджується B.1.617, хоча і з меншою ефективністю.

, директор , зазначив, що дослідження ефективності наявних вакцин до лінії поколінь В.1.617 свідчить про те, що після вакцинації перебіг захворювання проходить легше.

Ентоні Фаучі, , також висловив свою впевненість щодо попередніх результатів. В інтерв'ю 28 квітня він сказав:

Ще одне дослідження у Гайдарабаді показало, що вакциновані сироваткою Covishield (Оксфорд–АстраЗенека) забезпечують захист від лінії поколінь В.1.617.

ВООЗ заявила, що нинішні вакцини будуть і надалі ефективні проти цього варіанту. У своєму звіті в травні вони заявили, що можуть бути деякі докази «зменшеної нейтралізації». Дослідження, проведене , показало, що як вакцини Pfizer-BioNTech, так і AstraZeneca-Oxford забезпечують 33 % захист від симптоматичного захворювання, спричиненого цим варіантом після першої дози. Було виявлено, що через два тижні після другої дози вакцина Pfizer-BioNTech є на 88 % ефективною для зупинки симптоматичного захворювання з дельта-варіантом, тоді як вакцина AstraZeneca-Oxford була ефективною проти цього варіанту на 60 %.

Дослідження групи дослідників з , опубліковане в The Lancet, показує, що люди, повністю вакциновані вакциною Pfizer-BioNTech, швидше за все, матимуть у п'ять разів нижчий рівень нейтралізуючих антитіл проти дельта-варіанту.

У червні 2021 року оголосила, що провела дослідження, яке показало, що після двох ін'єкцій вакцини Pfizer-BioNTech та вакцина AstraZeneca, вона на 96 % та 92 % відповідно ефективно запобігають госпіталізації при інфікуванні дельта-варіантом.

Епідеміологія Нові дослідження припускають, що варіант може легше передаватися, ніж раніше поширені варіанти. Чи впливає дельта-варіант на ефективність застосовуваних в даний час вакцин, наразі досліджується.

Дані епіднагляду за показують, що близько 32 % пацієнтів, як госпіталізованих, так і поза лікарнями, були віком до 30 років у другій хвилі проти 31 % під час першої хвилі, а серед людей у віці 30–40 рівень зараження залишився на рівні 21 %. Госпіталізація у віці 20-39 років зросла до 25,5 % з 23,7 %, тоді як у діапазоні 0-19 років збільшилася до 5,8 % з 4,2 %. Дані також показали, що більша частка безсимптомних пацієнтів була прийнята лікарями під час другої хвилі, з більшою кількістю скарг на задишку.

Дані спостереження з США, Німеччини та Нідерландів вказують, що кількість дельта-варіанту зростає приблизно в 4 рази кожні два тижні порівняно з альфа-варіантом.

В Індії, Великій Британії, Португалії , Сполучених Штатах , Німеччині , Нідерландах і, мабуть, у багатьох інших країнах дельта-варіант вже є домінуючим варіантом вірусу. Зазвичай між ініфкуванням та повідомленнями про зараження проходить три тижні.

Статистика До 22 червня 2021 року в близько 78 країнах було виявлено понад 4500 послідовностей варіанту. Повідомлена кількість послідовностей у країнах, де виявлені такі випадки:

Кількість заражень за країнами Країна Підтверджені випадки дельта-варіантів:() станом на 29 червня Підтверджені випадки() станом на 2 липня Підтверджені випадки,усі 3 підлінії поколінь B.1.617() станом на 1 червня Випадки (інші джерела) Перше виявлення 63 629 85 592 9,273 22 лютого 2021 6,732 9 117 3,571 5 жовтня 2020 4,271 6 281 1,542 23 лютого 2021 171 977 345 4 589 15 березня 2021 1,392 2 046 420 1 березня 2021 823 977 156 26 лютого 2021 736 766 52 5 квітня 2021 556 723 65 22 квітня 2021 417 662 81 2 квітня 2021 275 633 105 8 березня 2021 384 588 120 25 березня 2021 398 515 4 16 21 квітня 2021 185 427 15 4 30 квітня 2021 215 382 32 3 квітня 2021 296 370 85 21 лютого 2021 212 271 64 29 березня 2021 196 270 144 16 березня 2021 245 251 50 6 квітня 2021 200 247 165 28 березня 2021 - - - 42 28 квітня 2021 96 113 35 41 16 квітня 2021 - 36 19 5 квітня 2021 82 106 34 16 26 квітня 2021 188 218 155 26 лютого 2021 - 23 15 9 березня 2021 - 41 7 24 квітня 2021 - 88 - 9 28 квітня 2021 - 8 8 14 січня 2021 - 10 8 22 квітня 2021 167 168 17 26 березня 2021 51 52 6 15 квітня 2021 - 20 7 26 березня 2021 - 6 - 5 28 квітня 2021 126 1 - 60 18 березня 2021 - 5 4 21 квітня 2021 43 95 20 9 28 квітня 2021 - 79 2 24 квітня 2021 - 10 2 23 березня 2021 - 3 2 10 березня 2021 - 1 - 2 24 квітня 2021 - 1 - 2 3 травня 2021 94 100 - 2 24 квітня 2021 - 4 - 19 березня 2021 - - - 6 Квітень 2021 - 3 3 16 квітня 2021 - 83 - 17 квітня 2021 - 15 - 2 28 квітня 2021 - 25 - 5 квітня 2021 - 1 - 23 квітня 2021 - - - 4 19 травня 2021 - 6 - 5 3 травня 2021 - - - (кількість не повідомляється) - 6 11 3 11 травня 2021 - 37 - 5 Травень 2021 - - - (кількість не повідомляється) - 24 - 10 квітня 2021 211 230 27 5 квітня 2021 - - - 1 Травень 2021 117 127 20 1 15 квітня 2021 - - - 1 Квітень 2021 - 32 19 26 квітня 2021 - 2 - 4 травня 2021 - 6 - 20 квітня 2021 - 6 - 1 30 квітня 2021 - 38 4 1 26 березня 2021 - - - 17 11 травня 2021 - - - (кількість не повідомляється) 54 72 - 12 18 квітня 2021 - 16 2 10SP identifica primeiro caso de variante do coronavírus em passageiro vindo da Índia 26/05/2021 g1.globo.com. Процитовано 26 травня 2021 Covid-19: Maranhão registra primeiros casos da variante indiana 21 травня 2021 pebmed.com.br. Процитовано 26 травня 2021 20 травня 2021 Coronavírus: Primeiro caso da variante indiana é confirmado no Paraná, diz Sesa (tr. "Coronavirus: First case of the Indian variant is confirmed in Paraná, says Sesa ") 02/06/2021 g1.globo.com. Процитовано 3 червня 2021 Variante delta do coronavírus é identificada e tem transmissão comunitária em Goiânia g1.globo.com. Процитовано 23 червня 2021 - 29 - 19 квітня 2021 - 1 - 26 квітня 2021 - 5 - 20 квітня 2021 - 9 - 16 травня 2021 - 10 - 1 17 червня 2021 - 28 - 11 червня 2021 - 16 - 15 травня 2021 - 14 - 30 квітня 2021 - 12 - 7 травня 2021 - 5 - 15 червня 2021 - 5 - 1 червня 2021 - 4 - 24 травня 2021 - 4 - 5 червня 2021 - 4 - 15 травня 2021 - 3 - 23 червня 2021 - 2 - 6 травня 2021 - 2 - 10 червня 2021 - 2 - 8 травня 2021 - 1 - 13 червня 2021 - 1 - 14 червня 2021 - 1 - 5 квітня 2021 - 1 - 20 квітня 2021Світ (91 країна) Всього: 77 544(виключно B.1.617.2) Всього: 108 057(B.1.617.2+AY.1+AY.2) Всього: 16 366 вкл. B.1.617.1, B.1.617.2, та B.1.617.3 3 341 Всього на 2 липня 2021.

Історія