Real Colegio de Loyola Główny budynek kompleksu, Real Colegio de Loyola (kast. Królewskie Kolegium Loyola), w zamyśle architektów tworzy rodzaj relikwiarza wokół domu narodzin św. Ignacego. Składa się on z centralnej bazyliki, zwieńczonej kopułą, która jest flankowana dwoma budynkami o długości 75 m każdy; budynek południowy kryje w sobie Casa Santa – dom rodzinny św. Ignacego. Klatka schodowa tego budynku nosi nazwę Schodów Świętych, budynku północnego – Schodami Papieży; nazwy wywodzą się od figur wieńczących schody na najwyższym piętrze, odpowiednio przedstawiających świętych lub papieży szczególnie przychylnych Towarzystwu Jezusowemu. alt=Dom rodziny Loyola (Casa Santa)|mały|241x241px|Dom rodziny Loyola (Casa Santa)
Bazylika alt=Kopuła bazyliki|mały|241x241px|Kopuła bazyliki Bazylika stanowi architektoniczną dominantę w budynku Real Colegio de Loyola, wyróżniając się monumentalną kopułą. W portyku znajdują się rzeźby św. Ignacego z Loyoli, św. Franciszka Ksawerego, św. Franciszka de Borja, św. Ludwika Gonzagi i św. Stanisława Kostki. Drzwi główne wykonane są z drewna cedrowego z Libanu, uzupełnianego częściowo drewnem mahoniowym. Kruchta, której ściany pokryte są mnóstwem ornamentów, jest popisem stylu churrigueresco;