Wśród mikroorganizmów występujących w fermentowanym tytoniu opisywano m.in. bakterie z rodzajów Bacillus, Pseudomonas, Enterobacter, Pantoea, Sphingomonas i Terribacillus. Mogą one uczestniczyć w rozkładzie skrobi, celulozy, hemicelulozy, białek i innych wielkocząsteczkowych składników liści, a także w tworzeniu lub przekształcaniu związków aromatycznych, takich jak alkohole, ketony i estry.
W przeglądzie badań z 2025 roku wskazano, że w starzeniu tytoniu istotną rolę odgrywają m.in. Acinetobacter, , Aspergillus, przedstawiciele Bacilli oraz Pseudonocardia. Mikroorganizmy te mogą wpływać na zawartość związków aromatycznych oraz uczestniczyć w przemianach niektórych alkaloidów, nikotyny i nitrozoamin obecnych w materiale tytoniowym.
Kontrola jakości i zagrożenia technologiczne Istotnym elementem prowadzenia fermentacji jest kontrola wilgotności, temperatury i warunków higienicznych. W technikach historycznych kontrola ta była związana przede wszystkim z obserwacją zachowania masy liściowej oraz regulowaniem warunków w pomieszczeniach fermentacyjnych.