Protein 120 domena upredene zavojnice (CCDC120), znan i kao JM11 protein, je protein koji je kod ljudi kodiran istoimenim genom CCDC120. Funkcija CCDC120 nije formalno identificirana, ali strukturne komponente, konzerviranost i interakcije mogu se izračunračunarski procijenitiati.
Gen Kod čovjeka, gen CCDC120 nalazi se na hromosomu X, na poziciji Xp11.23. Postoji šest različitih varijanti transkripta CCDC120 proizvedenih alternativnim splajingom.
Obilježja Transkript iRNK CCDC120 sadrži ponavljanje od 120 bp blizu 3' kraja. thumbnail|Na slici je vidljivo ponavljanje od 120bp
Homologija Paralozi CCDC120 has 3 identifiable paralogs in humans, FERM domen-sadržavajući 4A, FERM domomen-sadržavajući 4B i C1orf106.
Ortolozi Ortološki prostor CCDC120 može se pratiti do riba poput Danio rerio, Oryzias latipes i Dicentrarchus labrax.
Protein Protein CCDC120 ima četiri različite izoforme, u rasponu od 618 do 696 aminokiselina. Isoform 1 is the longest isoform and is encoded by transcript 1 of the CCDC120 gene.
Interakcije Eksperimentalno je pokazalano da postoje interakcije CCDC120 s vezujućim proteinom 1C Usherovog sindoma, CYTH2 MDFI, centrosomnim proteinom od 170kDa, pseudogenom 1 i keratinom 15]]. Ostale interakcije identificirane su koekspresijom i datiranjem podataka i mogu se vidjeti na slici. thumb|Interakcije proteina CCDC120 sa eksperimentalnim dokazima naznačenim ružičasto, koekspresijom (tamnozeleno) i miniranjem (svijetlozeleno). Slika je generirana aplikacijom STRING 9.05 (http://string-db.org/)
Posttranslacijske modifikacije Algoritmi sugeriraju brojna mjesta osforilacije serina, kao i nekoliko mjesta fosforilacije treonina i tirozina. Mnogo od ovih lokacija konzervirano je kod Gorilla gorilla gorilla , Mus musculus i Danio rerio . Identificirano je i jedno mjesto N-glikozilacije.
Struktura Predviđa se da proteinska struktura CCDC120 sadrži, kao što i samo ime govori, 65 aminokiselinskih zavojnica na položaju 109-173. Višestruki algoritmi identificiraju tri različita mjesta na kojima se alfa-heliksi mogu stvoriti strukture koje su konzervirana e u gorila i Danio rerio. Algoritmi se ne slažu ni na jednom mjestu za strukturu beta-lista.
Ekspresija Promotor Prema algoritmima, CCDC120 ima promotor dužine 601bp, koji sadrži niz mogućih mjesta faktora transkripcije, kao što je prikazano na slici. thumb|250px|Nukleotidna sekvenca promotora 601 bp za CCDC120, s ključnim faktorima transkripcije koji su dobro identificirani označenim algoritmima. (http://www.genomatix.de/)
Reference u naučnoj literaturi Utvrđeno je da je CCDC120 reguliran pod impulsnim elektromagnetskih polja u ljudskim osteoblastolikim ćelijama. CCDC120 ima 7-baznu deleciju kod metastaznog olfaktornog neuroblastoma. CCDC120 je smanjeno reguliran nakon hipoksično-ishemijske ozljede mozga novorođenih pacova.
Reference
Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu X