Član 2 porodice Tweety je protein koji je kod ljudi kodiran genom TTYH2. Članovi ove porodice funkcioniraju kao hloridni kanali. Kodirani protein funkcionira kao kalcij (2 +) aktivirani hloridni kanal (–) velike provodljivosti i može imati ulogu u bubrežnoj tumorogenezi. Za ovaj gen identificirane su dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.
Rae et al. (2001) utvrdili su da gen TTYH2 sadrži 14 egzona, veličine od 56 do 1.888 bp. Analizom FISH-a i genomske sekvence, mapirali su gen TTYH2 u hromosomski segment 17q24. Mapirali su i homolog miša na hromosomu 11.
Dužina polipeptidnog lanca je 534 aminokiseline, a molekulska težina 58.772.
Aminokiselinska sekvenca
1020304050 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGL VAAVCLGLNLIFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLIC CAAVGVGFYGNSETNDGAYQLMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDL EQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGSVVVQLSGLPVWREVTMELTK LSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKCLLASMLCCGA LSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTEGQISTEVTRYYLYC SQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLL LNSSESSLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAA LAFSTMICAGPRAWKHFTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWRMAAHSPPRGQL HSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLI GRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Koristeći PCR diferencijalnog prikaza, Rae et al. (2001) identificirali su novi genski proizvod koji je pojačan u karcinomima bubrežnih ćelija. Naknadno pretraživanje baza podataka o ovoj sekvenci omogućilo je sastavljanje klona pune dužine, označenog kao TTYH2, homologa Drosophila tweety. Izvedeni protein TTYH2 s 534 aminokiseline ima predviđenu molekulsku masu od 59,3 kD i sadrži pet predviđenih transmembranskih domena, kjednu kazein-kinazu II i dva fosforilacijska mjesta protein-kinaze C, četiri N-vezana mjesta glikozilacije, pet N-miristoilacijskih mjesta i RGD motiv potencijalno sposoban za vezanje integrina.
Protein TTYH2 dijeli 43% i 28% identiteta sekvence s ljudskim odnosno Drosophila tweety TTYH1,. Rae et al. (2001) također klonirali su miša Ttyh2; mišji i ljudski proteini dijele 81% identiteta sekvence. Northern blot analiza ljudskih tkiva otkrila je ekspresiju transkripta od 3,8 kb na najvišim nivoima u mozgu i sjemenicima, na nižim nivoima u jajnicima i srcu i na vrlo niskim nivoima u leukocitima, skeletnim mišićima, slezeni i perifernoj krvi. RT-PCR analiza otkrila je povišenu regulaciju TTYH2 u 13 od 16 (81%) karcinoma bubrežnih ćelija. Suzuki i Mizuno (2004) utvrdili su da je TTYH2 eksprimiran kao Ca (2+) ovisni unutra rektificiranog hloridnog kanala u transficiranim ćelijama jajnika kineskog hrčka. Na osnovu svoje analize tri kanala TTYH, zaključili su da porodica gena tweety kodira hloridne kanale velike provodljivosti.Rae, F. K., Hooper, J. D., Eyre, H. J., Sutherland, G. R., Nicol, D. L., Clements, J. A. TTYH2, a human homologue of the Drosophila melanogaster gene tweety, is located on 17q24 and upregulated in renal cell carcinoma. Genomics 77: 200-207, 2001. PubMed: 11597145Suzuki, M., Mizuno, A. A novel human Cl- channel family related to Drosophila flightless locus. J. Biol. Chem. 279: 22461-22468, 2004. [PubMed]: 15010458
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika