Kalcijem regulirani toplotno stabilni protein 1 (CARHSP1), znan i kao kalcij-regulirani toplotno-stabilni protein od 24 kDa (CRHSP-24), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom CARHSP1.
CARHSP1 sadrži domen hladnog šoka sa dva motiva koji vežu RNK. Proteini koji sadrže domene hladnog šoka vežu polipirimidinske regije jednolančane RNK i DNK i reguliraju translaciju ribosoma, razgradnju iRNK i brzinu završetka transkripcije. CARHSP1 ima ulogu u stabilizaciji iRNK TNF.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 147 aminokiselina, a molekulska težina 15.892 Da.
1020304050 MSSEPPPPPQPPTHQASVGLLDTPRSRERSPSPLRGNVVPSPLPTRRTRT FSATVRASQGPVYKGVCKCFCRSKGHGFITPADGGPDIFLHISDVEGEYV PVEGDEVTYKMCSIPPKNEKLQAVEVVITHLAPGTKHETWSGHVISS Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Korištenjem pacovskog Crhsp24 za ispitivanje EST baze podataka, Groblewski et al. (1998) identificirali su ljudski CARHSP1, kojeg su nazvali CRHSP24. Izvedeni hljudskii protein sa 147 aminokiselina sadrži gotovo 14% prolina i razlikuje se od pacovskog ortologa po samo pet ostataka. Northern blot analizom otkriveni su transkripti Crhsp24 od približno 2,9 i 0,7 kb u svim ispitivanim tkivima pacova, s najvećom ekspresijom u gušterači, sjemenicima, jetri i plućima. Western blot analiza tkiva pacova otkrila je očigledni protein od 24 kD sa sličnim profilom ekspresije. Imunohistokemijska analiza pankreasnog acinusa pacova pokazala je difuzno bojenje Crhsp24 u citoplazmi, sa malo ili nimalo bojenja u jedrima ili sekretornim granulama.
Pfeiffer et al. (2011) izvijestili su da mišji i ljudski CARHSP1 proteini dijele oko 97% identiteta aminokiselina i da oba sadrže domen hladnog šoka sa dva motiva koji vežu RNK. U RAW264.7 mišjeg makrofaga, Carhsp1 lokaliziran je u tijelima za obradu citoplazme koja sadrže translacijski potisnutu iRNK. Čini se da se Carhsp1 lokalizirao na egzosome, koji razgrađuju iRNK, ali se nije lokalizirao tanslacijom iRNK.Pfeiffer, J. R., McAvoy, B. L., Fecteau, R. E., Deleault, K. M., Brooks, S. A. CARHSP1 is required for effective tumor necrosis factor alpha mRNA stabilization and localizes to processing bodies and exosomes. Molec. Cell. Biol. 31: 277-286, 2011. PubMed: 21078874.
Funkcija gena Groblewski et al. (1998) otkrili su da je aktivator kalcineurina specifično defosforilirani Crhsp24 u acinarnim ćelijama pankreasa pacova. U baznom stanju izgledalo je da je Crhsp24 fosforiliran na četiri serina, od kojih je najmanje tri defosforilirano kalcineurinom, kao odgovor na mobilizaciju kalcija. Inhibicija kalcineurina sprečila je kalcij-ovisnu defosforilaciju Crhsp24. Schafer et al. (2003) otkrili su da ester forbol i sekretin (SCT) induciraju defosforilaciju Chrosp24 nezavisnu od kalcija u acinarnim ćelijama pacova. Studije inhibitora otkrile su da su esteri forbola i sekretina izazvali defosforilaciju Crhsp24 na najmanje dva serina, vjerovatno preko Pp2a ili Pp4 (PPP4C Schafer, C., Steffen, H., Krzykowski, K. J., Goke, B., Groblewski, G. E. CRHSP-24 phosphorylation is regulated by multiple signaling pathways in pancreatic acinar cells. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 285: G726-G734, 2003. [PubMed: 12801884
Koristeći analizu zadržavanja RNK, Pfeiffer et al. (2011) otkrili su da se CARHSP1 vezao za 3-primarni UTR TNF iRNK. Studije prekomkerne ekspresije i nokdaunskim u RAW264.7 mišjim makrofazima sugeriraju da je miš Carhsp1 stabilizirao Tnf i u mirovanju i u ćelijama stimuliranim lipopolisaharidima.
Hartz (2016) mapirala je gen CARHSP1 na hromosom 16, sekvenca p13.2, a na osnovu poravnanja sekvence CARHSP1 (GenBank AF115345) sa genomskom sekvencom (GRCh38).Groblewski, G. E., Yoshida, M., Bragado, M. J., Ernst, S. A., Leykam, J., Williams, J. A. Purification and characterization of a novel physiological substrate for calcineurin in mammalian cells. J. Biol. Chem. 273: 22738-22744, 1998. PubMed: 9712905
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika