Leucin-karboksil metiltransferaza 2 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom LCMT2.
Protein koji je kodiran ovim genom bez introna pripada superporodici metiltransferaza i djeluje kao regulator kontrolne tačke G(1)/S i G(2)/M. Pretpostavlja se da oksidativni stres izazvan dimom cigareta i transformirajući faktor rasta beta 1 mogu inhibirati ćelijsku proliferaciju, modulirajući ekspresiju ovog proteina.
Hibridnom analizom zračenja, Nagase et al. (1998) mapirali su gen LCMT2 na hromosom 4. Međutim, Hartz (2013) ga je mapirala je na hromosom 15, sekvenca q15.3, a na osnovu poravnanja sekvence LCMT2 (GenBank AF265443) sa genomskom sekvencom (GRCh37).Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 6/3/2013.Nagase, T., Ishikawa, K., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N., Ohara, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro. DNA Res. 5: 31-39, 1998. PubMed: 9628581
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 686 aminokiselina, a molekulska težina 75.602 Da ..
1020304050 MGPRSRERRAGAVQNTNDSSALSKRSLAARGYVQDPFAALLVPGAARRAP LIHRGYYVRARAVRHCVRAFLEQIGAPQAALRAQILSLGAGFDSLYFRLK TAGRLARAAVWEVDFPDVARRKAERIGETPELCALTGPFERGEPASALCF ESADYCILGLDLRQLQRVEEALGAAGLDAASPTLLLAEAVLTYLEPESAA ALIAWAAQRFPNALFVVYEQMRPQDAFGQFMLQHFRQLNSPLHGLERFPD VEAQRRRFLQAGWTACGAVDMNEFYHCFLPAEERRRVENIEPFDEFEEWH LKCAHYFILAASRGDTLSHTLVFPSSEAFPRVNPASPSGVFPASVVSSEG QVPNLKRYGHASVFLSPDVILSAGGFGEQEGRHCRVSQFHLLSRDCDSEW KGSQIGSCGTGVQWDGRLYHTMTRLSESRVLVLGGRLSPVSPALGVLQLH FFKSEDNNTEDLKVTITKAGRKDDSTLCCWRHSTTEVSCQNQEYLFVYGG RSVVEPVLSDWHFLHVGTMAWVRIPVEGEVPEARHSHSACTWQGGALIAG GLGASEEPLNSVLFLRPISCGFLWESVDIQPPITPRYSHTAHVLNGKLLL VGGIWIHSSSFPGVTVINLTTGLSSEYQIDTTYVPWPLMLHNHTSILLPE EQQLLLLGGGGNCFSFGTYFNPHTVTLDLSSLSAGQ Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Sekvenciranjem klonova dobijenih iz biblioteke moždane cDNK Nagase et al. (1998) klonirali su LCMT2, koji su označili KIAA0547. Transkript sadrži nekoliko ponavljajućih elemenata u svom 3-baznom UTR-u, a izvedeni protein sadrži 686 aminokiselina. RT-PCR je detektirao ekspresiju LCMT2 samo u bubrezima. In vitro translatirani LCMT3 imao je prividnu molekulsku masu od 61 kD, pomoću SDS-PAGE. Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika