Ataksin-3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ATXN3.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 364 aminokiseline, a molekulska težina 41 781 Da.
1020304050 MESIFHEKQEGSLCAQHCLNNLLQGEYFSPVELSSIAHQLDEEERMRMAE GGVTSEDYRTFLQQPSGNMDDSGFFSIQVISNALKVWGLELILFNSPEYQ RLRIDPINERSFICNYKEHWFTVRKLGKQWFNLNSLLTGPELISDTYLAL FLAQLQQEGYSIFVVKGDLPDCEADQLLQMIRVQQMHRPKLIGEELAQLK EQRVHKTDLERVLEANDGSGMLDEDEEDLQRALALSRQEIDMEDEEADLR RAIQLSMQGSSRNISQDMTQTSGTNLTSEELRKRREAYFEKQQQKQQQQQ QQQQQGDLSGQSSHPCERPATSSGALGSDLGKACSPFIMFATFTLYLTYE LHVIFALHYSSFPL Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Klinički značaj
Machado-Josephova bolest, poznata i kao spinocerebelarna ataksija-3, autosomno je dominantan neurvni poremećaj. Protein kodiran genom ATXN3 sadrži (CAG) n ponavljanja u kodirajućem području, a širenje tih ponavljanja sa normalnih 13-36 na 68-79 uzrok je Machado-Josephove bolesti. Postoji inverzna korelacija između starosti i broja ponovljenih CAG. Za ovaj gen su opisane alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.
Interakcije
Pokazano je da ataksin 3 komunicira sa: RAD23A, RAD23B, i VCP.
Modelni organizmi U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana Atxn3, generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije. +Fenotip Atxn3 nokaut-miša SvojstvoFenotip Vijabilnost homozigota Normalno Studija recesivne letalnostiNormalno Plodnost Normalno Tjelesna težina Normalno Test otvorenog polja: anksioznost Normalno Neurološka procjenaNormalno Snaga stiskaNormalno Test vruće ploče Normalno Dismorfologija Normalno Indirektna kalorimetrija Normalno Test tolerancije glukoze Normalno Slušni odgovor moždanog stabla Normalno DEXA Normalno Insulin Normalno Radiografija Normalno Tjelesna temperatura Normalno Morfologija oka Normalno Klinička hemija (nalaz)Normalno Plazmatski imunoglobulini Normalno Hematologija Normalno Leukociti periferne krvi Normalno Mikronukleus test Normalno Težina srca Normalno Histopatologija oka Normalno Salmonella infekcija Normal Citrobacter infekcija NormalSvi testovi i analize su iz Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Spinocerebellar Ataxia Type 3
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika