Argininom i glutamatom bogati protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ARGLU1, lociranom na poziciji13q33.3.
Proteinski proizvod ovog gena predložen je kao MED1-interakcijski protein potreban za estrogen-ovisnu transkripciju gena i rast ćelija raka dojke.
Gen ARGLU1 eksprimira najmanje tri različite izoforme prerade RNK – potpuno prerađena izoforma koja kodira protein, izoforma koja sadrži zadržani intron, u jedru i izoforma koja sadrži alternativni egzon koji cilja transkript za nonsens propadanje. Nadalje, ARGLU1 sadrži dugu, evolucijski visoko konzerviranu sekvencu poznatu kao ultrakonzervirani element (UCE) koja se nalazi unutar zadržnog introna i preklapa alternativni egzon.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 273 aminokiseline, a molekulska težina 33.216 Da.
1020304050 MGRSRSRSSSRSKHTKSSKHNKKRSRSRSRSRDKERVRKRSKSRESKRNR RRESRSRSRSTNTAVSRRERDRERASSPPDRIDIFGRTVSKRSSLDEKQK REEEEKKAEFERQRKIRQQEIEEKLIEEETARRVEELVAKRVEEELEKRK DEIEREVLRRVEEAKRIMEKQLLEELERQRQAELAAQKAREEEERAKREE LERILEENNRKIAEAQAKLAEEQLRIVEEQRKIHEERMKLEQERQRQQKE EQKIILGKGKSRPKLSFSLKTQD Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Zhang et al. (2011) klonirano ljudsko ARGLU1. Izvedeni protein od 273 aminokiseline ima pozitivno nabijeni N-terminalni domen bogat argininom i negativno nabijen C-terminaln domen bogat glutamatom. Također ima nekoliko signala za jedarnu lokalizaciju. Imunohistohemijska analiza otkrila je da je ARGLU1 pretežno lokaliziran u jedru ćelija raka dojke MCF-7, gdje se kolokalizirao s podjedinicom kompleksa medijator-1 (MED1). Analiza baze podataka otkrila je ortologe ARGLU1 u rodu Drosophila i miševima, ali ne i u kvascu.Zhang, D., Jiang, P., Xu, Q., Zhang, X. Arginine and glutamate-rich 1 (ARGLU1) interacts with Mediator subunit 1 (MED1) and is required for estrogen receptor-mediated gene transcription and breast cancer cell growth. J. Biol. Chem. 286: 17746-17754, 2011. PubMed: 21454576
Funkcija gena Kompleks medijator je veliki proteinski kompleks, koji prenosi signale od transkripcijskih aktivatora do RNK- polimeraze II i općeg mehanizma za transkripciju. Kompleksi posrednika koji uključuju MED1 komuniciraju s estrogenim receptorima (ER ili ESR1) i posreduju u funkcijama ovisnim o estrogenu. Koristeći masenu spektrometriju, Zhang et al (2011) otkrili su da je ARGLU1 bio u interakciji s MED1, ali ne i s drugim podjedinicama medijatora. Analize imunoprecipitacije i povlačenja proteina potvrdile su njihovu direktnu interakciju. Analiza mutacije otkrila je da je za interakciju potrebna C-terminalna regija MED1 i N-terminalna regija ARGLU1. Ektopiijska ekspresija samog ARGLU1 povećala je aktivnost reportera ovisnu o estrogenu u ćelijama MCF-7, a koekspresija MED1 s ARGLU1 dodatno je povećala aktivnost reportera ovisnu o estrogenu. RNK kratke ukosnice usmjerena protiv ARGLU1 oslabila je estrogeno ovisnu indukciju ER ciljnih gena. Analiza imunoprecipitacije hromatina pokazala je da su i ARGLU1 i MED1 regrutirani kao kompleks za promotore ER ciljnih gena. Nokdaun studije pokazale su da je ARGLU1 potreban i za ovisnost o sidrištu i o nezavisnom rastu ćelija MCF-7. Pretpostavili su da ARGLU1 može imati regulatornu ulogu preko interakcije s kompleksima posrednika MED1.<ref name=
Magomedova et al. (2019) identificirali su evolucijski konzervirani gen ARGLU1 tokom pregleda za modulatore signalizacije glukokortikoida u CNS -u. Inhibicija ARGLU1 u neuronskim čelijama miša rezultirala je velikim promjenama u ekspresiji ili preradom drugih gena uključenih u neurogenezu. Nokaut kod zebrice uzrokovao je neurorazvoj i srčane greške, a homozigotnost za nokaut Arglu1 cijelog tijela bila je letalna za mišje embrione. Autori su zaključili da je ARGLU1 potreban za moduliranje bazne transkripcije i oreradu tokom embrionskog razvoja u neuronskim ćelijama.Magomedova, L., Tiefenbach, J., Zilberman, E., Le Billan, F., Voisin, V., Saikali, M., Boivin, V., Robitaille, M., Gueroussov, S., Irimia, M., Ray, D., Patel, R., and 10 others. ARGLU1 is a transcriptional coactivator and splicing regulator important for stress hormone signaling and development. Nucleic Acids Res. 47: 2856-2870, 2019. PubMed: 30698747 Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika