Citoskeletno pridruženi protein 4 je protein genkoji je kod ljudi kodirran genom CKAP4.
CKAP4 također historijski poznat kao CLIMP-63 (membranski protein 63 koji povezuje citoskelet) ili samo p63 (tokom 1990-ih) je obilan tip II transmembranskih proteina koji pretežno prebiva u endoplazmatskom retikulumu (ER) eukariotskih ćelija i kodiran kod viših kičmenjaka genom CKAP4.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 602 aminokiseline, a molekulska težina 66.022 Da..
1020304050 MPSAKQRGSKGGHGAASPSEKGAHPSGGADDVAKKPPPAPQQPPPPPAPH PQQHPQQHPQNQAHGKGGHRGGGGGGGKSSSSSSASAAAAAAAASSSASC SRRLGRALNFLFYLALVAAAAFSGWCVHHVLEEVQQVRRSHQDFSRQREE LGQGLQGVEQKVQSLQATFGTFESILRSSQHKQDLTEKAVKQGESEVSRI SEVLQKLQNEILKDLSDGIHVVKDARERDFTSLENTVEERLTELTKSIND NIAIFTEVQKRSQKEINDMKAKVASLEESEGNKQDLKALKEAVKEIQTSA KSREWDMEALRSTLQTMESDIYTEVRELVSLKQEQQAFKEAADTERLALQ ALTEKLLRSEESVSRLPEEIRRLEEELRQLKSDSHGPKEDGGFRHSEAFE ALQQKSQGLDSRLQHVEDGVLSMQVASARQTESLESLLSKSQEHEQRLAA LQGRLEGLGSSEADQDGLASTVRSLGETQLVLYGDVEELKRSVGELPSTV ESLQKVQEQVHTLLSQDQAQAARLPPQDFLDRLSSLDNLKASVSQVEADL KMLRTAVDSLVAYSVKIETNENNLESAKGLLDDLRNDLDRLFVKVEKIHE KV Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Lokalizacija, molekulske funkcije i regulacija Ćelijska distribucija CLIMP-63 je procenjivana (i ponovo procenjivana) nekoliko puta u posljednje dva desetljeća. Protein uključuje citosolni segment, sastavljen od pozitivno nabijenih aminokiselina (2-23) koji bi mogao djelovati kao prevladavajući motiv za savijanje proteina i lokalizaciju ER. CLIMP-63 bio je jedan od prvootkrivenih proteina za oblikovanja ER-a i najpoznatiji učesnik u generiranju održsvnja listovs ER-a. Smatra se da se to događa nakon dimerizacije lumenskih upredenozavojničkih domena CLIMP-63 u cis (dva CLIMP-63 proteina istog ER membranskog sloja) i/ili trans položaju (između dva različita sloja ER membrane, preko lumena ER). Multimerizacija bi dodatno mogla ograničiti širenje CLIMP-63 iz ER-listova.
Pokazalo se i da CLIMP-63 veže mikrotubule, preko kroz citoplazmatskog poremećenog repa, što bi moglo pomoći u pričvršćivanju ER-listova za citoskelet. Ovo je regulirano fosforilacijom najmanje tri serinska ostatka citosolnog repa CLIMP-63 (S3, S17 i S19), jer fosforilacija ometa kapacitet vezanja mikrotubula CLIMP-63.
Osim toga, CLIMP-63 može proći još jednu posttranslacijsku modifikaciju, S-palmitoilaciju na cisteinu 100 svog citoplazmatskog domena. Do sada je samo palmitoil-aciltransferaza ZDHHC2 identificirana kao potencijalni regulator palmitoilacije CLIMP-63, ali kako se ZDHHC2 uglavnom nalazi na plazmamembrani, potrebna su dodatna istraživanja. Posljedice S-palmitoilacije tek treba istražiti, ali bi mogle imatiati ulogu u ćelijskom ciklusu, jer je prijavljeno da se tokom mitoze palmitoilacija CLIMP-63 snažno povećava.
Konačno, različite grupe pokazale su da CLIMP-63 služi kao receptor na ćelijskoj površini, za različite vanćelijske ligande, posebno za surfaktant-protein A (SP-A) u plućnim alveolama,tkivni plazminogen-aktivator (tPA) u vaskularnim ćelijama glatkih mišića i za antiproliferativni faktor (APF) u epitelnim ćelijama bešike pacijenata sa poremećajem zvanim intersticijski cistitis.
Bolesti
U novije vrijeme CLIMP-63 je povezan s prognozama različitih tipova kancera. Povišena regulacija CLIMP-63 opažena je kod karcinoma holangio-ćelijskog i hepatoćelijskog karcinoma i korelira s pojavom metastaza u limfnim čvorovima.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 12 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika