280px|Ova slika pokazuje da je antisens RNA komplementarna njenom osjetilnom transkriptu. |thumb|right| Antisens RNK je transkribovana iz zaostajućeg lanca gena i komplementarna je sa specifičnom iRNK ili smislenom transkripcijom. Antisensna RNK (asRNK), označavan i kao antisens transkript, prirodni antisens transkript (NAT) ili antisens oligonukleotid, je jednolančana RNK koja je komplementarna s proteinom koji kodira iRNK s kojim se hibridizira, te na taj način blokira svoju translaciju u protein. asRNK (koje se pojavljuju prirodno) nađene su i u prokariotima i u eukariotima, i mogu se klasificirati na kratke (< 200 nukleotida) i duge (> 200 nukleotidA) nekodirajućih RNK (ncRNK). Primarna funkcija asRNK je regulacija ekspresije gena. asRNK se takođe mogu proizvesti sintetski i našle su široku upotrebu kao istraživački alati za nokdaun gena. Mogu imati i terapijsku primjenu. Primarna funkcija asRNK je regulacija ekspresije gena. asRNK se također mogu proizvesti sintetski i našle su široku upotrebu kao istraživački alati za nokdaun gena. Mogu imati i terapijsku primjenu.
Primjeri za različite vrste Početne otkrivene asRNK bile su u prokariota uključujući plazmidd, bakteriofage i bakterije. Naprimjer, u plazmidu ColE1, asRNK zvana RNK I ima važnu ulogu u određivanju broja kopija plazmida, kontrolom replikacije. Replikacija ColE1 oslanja se na transkripciju početne RNK pod imenom RNK II. Nakon što se RNK II transkribira, hibridizira se u svoj šablon DNK, a zatim se cijepa pomoću Rnaze H. U prisustvu asRNK RNK I i RNK II, tvore dupleks koji uvodi konformacijsku promjenu RNK II. Zbog toga se RNK II ne može hibridizirati sa svojim DNK šablonom, što rezultira malim brojem kopija ColE1. U bakteriofagu P22, asRNK sar pomaže u regulaciji između liznog i lizogenog ciklusa, kontrolom ekspresije Ant. Osim što su eksprimirane u prokariotima, asRNK otkrivene su i u biljkama. Najviše opisani primjer regulacije asRNK u biljkama je na genu cvjetnom lokusu C (FLC). FLC gen u Arabidopsis thaliana kodira transkripcijski faktor koji sprječava ekspresiju niza gena koji induciraju cvjetnu tranziciju. U hladnom okruženju, asRNK FLC gena, označena sa COOLAIR, eksprimira se i inhibira ekspresiju FLC putem hromatinske modifikacije, koja posljedično omogućava cvjetanje. U ćelijama sisara tipski primjer regulacije asRNK je inaktivacija X hromosoma. Xist, asRNK, može regrutirati polikombinski represivni kompleks 2 (PRC2) što rezultira heterohromatizacijom X hromosoma.
Klasifikacija Antisens RNK mogu se klasificirati na različite načine. U smislu regulatornih mehanizama, neki autori grupiraju asRNK u interakcije RNK-DNK, interakcije RNK-RNK bilo u jedru ili citoplazmi i interakcije RNK-protein (epigenetičke). Antisensne RNK mogu se kategorizirati i prema tipu promotora koji iniciraju ekspresiju asRNK: nezavisni promotori, zajednički dvosmjerni promotori ili kriptni promotori. Što se tiče dužine, iako je asRNK općenito klasificirana pod lncRNK, postoje kratke asRNA duljine manje od 200 parova baza. Budući da je ustanovljeno da je regulatorni mehanizam asRNK specifičan za vrstu, asRNK se također može klasificirati prema vrstama. Jedan od uobičajenih metoda klasifikacije asRNK je način na koji se asRNK transkribiraju u odnosu na ciljne gene: cis-djelovanje i trans-djelovanje.
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Nekodirajuća RNK