Porta San Marco è uno dei quattro comuni, denominati "cortine" (gli altri erano Porta al Borgo, Porta Lucchese e Porta Carratica) in cui fu diviso il contado della città di Pistoia (il cui territorio comunale era delimitato dalle mura medievali) fino al 1877, anno un cui furono annessi a quest'ultimo.
Il comune di San Marco, che prendeva il nome dall'omonima porta, si estendeva per circa e confinava con i comuni di Pistoia, Porta al Borgo, Sambuca Pistoiese, Cantagallo, Montale e Porta Carratica.
Al momento della soppressione il comune contava abitanti e comprendeva le località di Sant'Agostino, Baggio, Bigiano (già Comunello di Pulica), Candeglia, Chiesina, Germinaia, Iano, Santomato, Santomoro, San Quirico in Val di Bure, San Rocco e Val di Bure.
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