Y-хромосома є однією з двох статевих хромосом у більшості ссавців включаючи людину. У ссавців Y-хромосома містить ген SRY, який відповідає за розвиток яєчок. Ця хромосома складається з 60 мільйонів пар нуклеотидів. ДНК Y-хромосоми передається від батька до сина, що може бути використано при дослідженні генеалогічного дерева. Еволюційний розвиток Y-хромосоми вважається найшвидшим серед інших складових геному. 2023 року науковці вперше повністю секвенували Y-хромосому людини та виявили 41 новий ген.

Гени Деякі досліджені гени, що розташовані на Y-хромосомі, без урахування псевдоавтосомних генів

NRY, з відповідним геном на X хромосомі AMELY/AMELX — Амелогенін RPS4Y1/RPS4Y2/RPS4X — Рибосомний протеїн S4

NRY, інші  — Азооспермія (фактор 1) BPY2 — Базовий протеїн Y-хромосоми DAZ1 — Делеція при азооспермії DAZ2  — Протеїнкіназа, Y-зачеплена RBMY1A1 — частина ДНК, яка кодує специфічний білок SRY — Ділянка детермінації статі, Синдром Сваєра TSPY — Специфічний протеїн яєчок USP9Y UTY —Гістон-деметилаза ZFY — Цинковий палець

Див. також Y-хромосомний Адам Tokudaia osimensis

Примітки